这次刑部十三司会审可是审出了猛料的，不管是刑部、都察院还是大理寺这样的法司衙门，还是朝廷的其他部院，都为之震动，群情激奋之下的臣子们纷纷上疏，要求严究此事，东阁大学士吴道南等人上疏要求严究，而首辅方从哲则是以密揭的形式给万历上疏，请求皇帝亲自解决此事。
方从哲很清楚，此事如果不迅速解决的话，恐怕所造成的影响将会是极大的，关键是现在张差的口供已经完全指向郑贵妃身边的太监了，如果再不处理，任由发酵的话，肯定是要出大事的。
朱翊钧当然也知道其中的要命之处，他之所以放任刑部去查察此案，一方面是因为朱翊钧现在确实是有些怠惰，很多的事情都采取的是看一看再说，第二就是对于这次的事情，朱翊钧是极为不满的，不管怎么说，朱常洛也是朱翊钧的儿子，是大明的太子，闯宫刺杀，这是朱翊钧所绝对不能容忍的事情。
而且对于郑国泰等人这些年做的事情，朱翊钧其实是心知肚明的，真当厂卫是摆设吗，很多事情，朱翊钧只不过是不想追究罢了，毕竟朱翊钧在这件事情上对于郑贵妃有亏欠的，所以朱翊钧很多时候选择不干预。
但是这次的事情，朱翊钧必须要干预了，这已经触及了朱翊钧的底线了，对于郑国泰等人的猖狂，朱翊钧也是极为反感的，所以这次朱翊钧故意放纵刑部查下去，果不其然，这把火已经烧到了郑贵妃这里来了。
朱翊钧将司礼监掌印李恩叫来了，将张问达的奏疏给他，问道：“此事应该怎么处理啊？”
李恩当然明白朱翊钧的意思，就是在问庞保、刘成应该怎么处理这个问题上，李恩是很清楚朱翊钧的意思的，既要敲打郑氏，但是不能真的放纵此案就这么查下去，何况庞保、刘成是内侍，交给刑部是不合常理的。
李恩斟酌了一下之后说道：“皇爷，刑部此本恐怕不妥，内侍纵然有罪，也应该内廷审断，断无交给刑部的道理。”
当然除了这个原因之外，还有一个重要的原因，就是一旦将庞保、刘成交给刑部审断的话，难保不会审出什么令朱翊钧更加难堪的事情来，张差的供词毕竟没有直接牵涉到郑贵妃，但是庞保、刘成是可能直接将郑贵妃供出来的，所以绝对不能交给刑部。
这点朱翊钧自然是知晓的，所以他对李恩说道：“既然有成例，就照此办理吧。”
李恩赶紧领命，去翊坤宫抓捕庞保和刘成两人，李恩的行动很快就在宫内传开了，连在慈庆宫的朱常洛也很快就知道了此事，宫内的这些太监们是最会看风向的，现在朱翊钧和朱常洛父子关系好转，而且朱常洛还是太子，这些太监们已经纷纷倒向了朱常洛，为朱常洛通风报信了。
而在翊坤宫，郑贵妃已经慌神了，以往不管外廷说什么，朱翊钧总是会无条件的维护郑贵妃，这也是她的底气所在，但是这次朱翊钧没有再次无条件的支持郑贵妃，所以她慌神了，她很清楚自己和郑国泰之所以能够无所顾忌，主要就是朱翊钧的纵容，但是皇帝不再纵容的话，对于郑氏一门来说，就是要命的事情了。
而正在翊坤宫乱作一团的时候，朱翊钧到了，郑贵妃赶紧前来迎接，朱翊钧进了翊坤宫之后，郑贵妃自然就是开始哭诉了，对于郑贵妃的这些哭诉，朱翊钧是极为不耐烦的，他说道：“怎么，敢做不敢当？”
郑贵妃自然是哭的梨花带雨，连脸上的妆都花了，她说道：“皇爷，妾岂敢谋害哥儿，皇爷明鉴啊！”
以往郑贵妃用这招，自然是无往而不利的，但是这次，朱翊钧并没有像之前那样，脸上古井无波，甚至有一些讥诮，等到郑贵妃不表演了之后，朱翊钧才说道：“此事，朕说了不算，要哥儿说了才算。”
郑贵妃明白了朱翊钧的意思，就是郑贵妃必须得到朱常洛的原谅才行，否则的话，是无法平息外廷的怒火的，郑贵妃赶紧说道：“妾知道了。”
朱翊钧说道：“过两日朕会召太子到坤宁宫来，成与不成，就看哥儿了。”
郑贵妃赶紧答应下来，思索应该怎么面对太子，这次郑贵妃很清楚，自己和郑氏算是把太子给得罪死了，而且朱翊钧也不愿再无底线的维护郑氏了，这对于郑氏来说是极为不利的。
朱翊钧看了郑贵妃一眼，接着说道：“郑国泰要是再不老实，朕就送他去诏狱！”
郑贵妃赶紧说道：“妾会告知阿兄，让他谨守本分的。”
第二天司礼监文书房极为热闹，京师的官员们，不管是部院九卿，还是科道言官，部院司官等都纷纷上疏，要求严究此案，官员们几乎已经是确定郑氏就是凶手的。
礼部左侍郎署部事何宗彦上疏称：“张差一事，真亘古奇变，皇上初下法司，竟无严旨。王之寀一疏，皆有根据，法当严究，今已旬日，尚未报闻。”
而大理寺丞王士昌则是对于朱翊钧阴阳怪气了一番，他说朱翊钧对于此事的处理就似路人赴诉于不相知者，当王之寀审讯出真相以后，“亦竟高阁”。认为其中是不是有什么猫腻。
对于这些奏疏，朱翊钧祭出不报大法，根本不予理睬，同时批答了方从哲的密揭，朱翊钧御批道：“此中种种，疯癫奸徒张差持梃闯入慈庆宫，震惊皇太子。朕思太子乃国家根本，已传谕本宫添人守门，关防护卫。既有主使之人，即着三法司会同拟罪具奏。元辅当于中主持，使朝廷安定。”
方从哲收到了朱翊钧的御批之后，随即开始仔细思量起来了，方从哲当然是很清楚朱翊钧的意思，此事在朱翊钧看来已经处理的差不多了，不能够再进一步扩大了，所以现在朱翊钧要方从哲将此事结案，予以了结。