三月戊辰（三十日），司空张纯去世。
夏季，四月癸酉（初五），光武帝返回京城皇宫。己卯（十一日），大赦天下，改年号。
光武帝出巡，临幸长安。五月乙丑（二十八日），返回京城皇宫。
六月辛卯（二十四日），任命太仆冯鲂为司空。
六月乙未（二十八日），司徒冯勤去世。
京城有甘泉涌出，又有朱红之草生在水畔，各郡、各封国也纷纷上报天降甘露。百官奏称：“祥瑞频繁降临，应当命令太史予以收集，载入史册，以流传后世。”光武帝不采纳这个建议。他谦虚地认为自己并无多少德行，对各郡各封国所上关于祥瑞的奏报，每每表示退让而不敢当，因此史官很少得以记录。
秋季，有三个郡和封国发生蝗灾。
冬季，十月辛未（初六），任命司隶校尉、东莱人李诉为司徒。
十月甲申（十九日），命令司空在汉高祖庙祭祀禀告：尊称薄太后为高太后，在地神之旁配享祭飨。将吕太后的牌位迁到墓园，保留四季的祭祀。。
十一月甲子晦（疑误），出现目食。
本年，兴建用于朝会和祭祀大典的明堂、皇家观测天象的灵台、太学辟雍。向天下公布预言吉凶的符命之书图谶。当初，光武帝认为自己是应验了《赤伏符》的预言而登上帝位的，因此相信符谶，多用来解决疑难困惑。
给事中桓谭上书劝谏道“但凡人之常情，总是忽略眼前的常见事物而看重奇异的传闻。察看圣明先王的史迹，都以仁义正道作为根本，并无奇异怪诞的事情。天道与命运，是圣人也难以阐说的高深莫测的问题，自子贡以后，已听不到孔子讲述。何况后世学识浅陋的儒生，能通晓吗？
如今一些有聪明、小技能的人，编造图书，伪称这就是符谶，用来欺骗迷惑贪心大、不正派的人，连累了君主，对他们怎能不拒而远之呢！我听说陛下对方士烧炼丹药点化金银之术穷根充底，百般质疑，甚是英明，但却愿意听从符谶之言，这又是何等的失误！符谶的预言虽然有时与事实相符，但这不过如同占卜单双之类，总有巧合。
陛下应当听取正确意见，发扬圣明思想，摒弃那些小人的邪说，遵循儒学五经—《诗经》《书经》《礼记》《易经》《春秋》所讲述的正道。”奏书呈上，光武帝感到不快。适逢朝廷为灵台选址进行讨论，光武帝便对桓谭说：“我打算用符谶来决定此事，怎么样？”桓谭沉默不语，过了很久才说：“我不读符谶之书。”
光武帝问原因，桓谭再次极力论说符谶之书不是经典。光武帝大怒道：“桓谭诽谤神圣，目无国法，把他带下去，斩首！”桓谭叩头请罪，直至头部流血。过了很久，光武帝之怒才告平息。桓谭调走担任六安郡丞，在赴任途中病死。
范晔论曰：桓谭因反对符谶而流亡，郑也反对符谶，但由于言辞恭顺，仅免一死；而贾逵却以能对符谶附会演绎，最为显贵。世上的君主用这种标准来对待学术，真是可悲啊。
贾逵是扶风人。
南匈奴单于比去世。他的弟弟左贤王莫继位，此即丘浮尤提单于。光武帝派使者带着诏书会见单于，举行授玺仪式，并赏赐单于官服、官帽和什色绸缎。自此以后，便成为常例。
二年（丁巳，公元57年）
春季，正月辛未（初八），在京城北郊始立社坛，祭祀后土神。
二月戊戌（初五），光武帝在南宫前殿驾崩，享年六十二岁。光武帝生前，每日早晨主持朝会，午后才散，屡屡召见公卿、郎将讲说经书义理，到半夜才睡。皇太子见光武帝辛勤劳苦而不知疲倦，找机会劝谏道：“陛下有夏禹、商汤的圣明，却没有黄帝、老子涵养本性的福分。希望您爱惜身体而颐养精神，悠游岁月而自求宁静。”
光武帝说：“我自己乐于作这些事，不为此感到劳累！”光武帝虽以武力建立帝业，但到了天下安定之后，却并不重用有功的武将，反而提拔文官。他清醒谨慎地制定国策大权总揽，审时度势，量力而为，措施得当，所以能恢复前代的功业，在有生之年实现了天下太平。
太尉赵熹主持治丧。当时经历了王莽之乱，旧的典章制度已不复存在。皇太子与诸亲王杂处，不分座次。封国的官员出入宫禁，与朝廷百官没有区别。
赵熹神情严肃，在殿阶上手按剑柄，将诸亲王扶下大殿，以明尊卑之分。并上奏书，请求派谒者护送封国官员分别迁到外县，命诸亲王一一回到本封国设在京城的官邸，只准在上午和下午入宫哭悼使礼仪分明，门禁森严，朝廷内外井然有序。
皇太子刘庄即帝位，将阴皇后尊称为皇太后
山阳王刘荆在哭悼先帝时不悲伤，却写了一封匿名信，让他的奴仆诈言大鸿胪郭况写信给东海王刘强。说刘强无罪而被废去皇太子之位，母亲郭后也遭罢黜屈辱，劝刘强回到东方起兵，夺取天下。并且说：“高祖起兵时，只是一个亭长；陛下在白水乡间，兴起了大业；何况大王身为陛下长子、原来的储君？
您应当做秋天寒霜，肃杀万物；莫做圈栏之羊，受人宰割。皇上驾崩，民间百姓尚且要做强盗，准备有所图谋，何况大王呢！”刘强收到此信，又惊又怕，立即抓住冒充信使的奴仆，将原信封好，上呈明帝。明帝因刘荆是同母胞弟，便将此事保密，命令刘荆离开京城，移居到河南宫。
三月丁卯（初五），将光武帝葬在原陵。
夏季，四月丙辰（二十四日），明帝下诏：“朕如今在上没有先帝，在下没有重臣，就像涉越深渊而没有舟船桨楫。皇上的责任，至为重要，而年轻人的思虑，往往轻率，朕实在有赖于年高德劭的长辈辅佐。
高密侯邓禹是功臣的首领，东平王刘苍宽厚渊博而有谋略。兹任命邓禹为太傅，刘苍为骠骑将军。”刘苍恳切地推辞这一任命，但明帝不许。明帝又下诏命令骠骑将军府设置长史、掾史等属官四十人，使骠骑将军的地位高于三公。刘苍曾向朝廷举荐西曹掾齐国人吴良，明帝说：“为国举荐贤才，是宰相的职责。当初萧何推举了韩信，便设坛授官，不再考试。今任命吴良为议郎。
起初，西羌烧当部落首领滇良打败先零，夺取了先零的领地。滇良死后，他的儿子滇吾继位，该部落日趋强盛。在本年秋季，滇吾同他的弟弟滇岸率领部众入侵陇西郡，在允街打败了陇西太守刘盱。于是，原来为陇西郡守卫边塞的羌人全部背叛了汉朝。明帝下诏命令谒者张鸿率领各郡郡兵讨伐羌人。双方在允吾县交战，张鸿被打败，全军覆没。冬季，十一月，明帝又派中郎将窦固监督捕虏将军马武等两名将军，率领四万兵众讨伐羌人。
本年，南匈奴单于莫去世，他的弟弟汗继位，此即伊伐於虑袭单于。
元年（戊午，公元58年）
春季，正月，明帝率领公卿及百官在原陵朝拜，如同光武帝生前举行元旦朝会的仪式。明帝先在光武帝的牌位前吓拜，然后退下，坐在东厢。侍卫官全都围列在牌位之后，由太官献上御膳，太常演奏乐曲。各郡、各封国呈送年终考绩的官员—上计吏依次上前，在供奉光武帝牌位的大堂上奏报本地的粮价和人民疾苦之事从此以后，这项仪式便成为固定的常例。
夏季，五月，高密元侯邓禹去世。
东海恭王刘强病重，明帝派使者和太医乘驿车前往诊治疾病，车马络绎不绝。明帝还下诏命令沛王刘辅、济南王刘康、淮南王刘延去东海国首府鲁城探望刘强的病情。五月戊寅（二十二日），刘强去世。临死前，他曾上书叩谢皇恩，书中写道：“我自身已是短命，留下的孤儿寡妇还要让皇太后和陛下操心忧虑，我真是又悲伤又惭愧！我的儿子刘政是个幼童，本当勉强继承我的爵位和封土，但这必定不是保护他的万全之计，我请求交还封国，将东海国恢复为东海郡。
如今天下刚刚经历了大变故，我盼望陛下加倍奉养皇太后，多进餐饭。我困顿衰颓，言辞不能表达全部心意，愿一并向各位亲王辞别想不到我们永远不能再相见了！”明帝见到遗书，十分悲痛，跟随太后出城，临幸津门亭，为刘强举哀。明帝命令大司空持御赐符节督治丧事，对刘强的赏赐赠送超过通常的礼仪，下诏命令楚王刘英、赵王刘栩、北海王刘兴以及在京城的亲戚们都去参加葬礼。
明帝追念刘强坚持谦恭节俭，不愿违背他的原意实行厚葬，于是发布特诏：“东海王的随葬物品，务必符合简单俭省的原则，寿衣足以包住身体即可，要用茅草之车，陶瓦之器，物品少于通常制度以此显示东海王卓尔不群独行特立的志节。”并命令将作大匠留在东海国兴建王陵祭庙。
秋季，七月，马武等攻打烧当羌，烧当羌大败。一同叛乱的其他羌人部落全部投降或逃散。
山阳王刘荆私下聘请利用星象占验吉凶的星家，与他们一同谋划，希望天下发生变故。明帝听说此事，便将刘荆改封为广陵王，命他前往广陵国。辽东郡太守祭肜派鲜卑首领偏何讨伐赤山的乌桓部落，大败乌桓人，斩杀其首领。塞外震恐，西起武威郡，东到玄菟郡，各异族部落都来归附汉朝。边疆不再有烽烟与战尘，于是东汉朝廷将屯驻边境的军队全部撤走。
东平王刘苍认为东汉中兴三十多年，四方安宁无忧，应当建立礼乐制度。于是，他和公卿一同商讨制定了在京城南郊祭天、北郊祭地时所用的冠帽、车马、衣服等制度，以及祭祀光武庙时所用的歌乐和八佾舞的形式，向明帝呈报。
好畤愍侯耿弇去世。