这故事得从碧如莫逛古玩市集说起。那天，她在市集里溜达，瞅见一幅破破烂烂的唐卡。这唐卡上画着绿度母，那绿度母的眼睛里嵌着暗红的结晶，瞅着怪渗人的。摊主跟她说，这唐卡可有年头了，是百年前一个被活活剥皮的画师画的。碧如莫也不知道咋想的，鬼使神差就把这唐卡买下来了。
当天晚上，碧如莫拿着矿物颜料去修补唐卡上的裂缝。嘿，怪事就这么来了！她手指尖突然就渗出血珠，那血的颜色跟颜料一模一样，顺着画布的纹路就渗进度母的衣褶里去了。第二天一大早，她发现右手的血管上，浮现出跟唐卡纹路一样的金绿色脉络，就跟画上去似的。
等唐卡修复好的那天晚上，碧如莫做了个怪梦。她梦见自己变成画里的度母，往下一看，是一间石屋。石屋里有个画师，被铁钉钉在墙上，有个人正拿着利刃，慢慢剥她的皮，那场面，想想都吓人。碧如莫一下子就惊醒了，一瞧，血管上的纹路都蔓延到肩颈了。她往床头的镜子里一瞅，妈呀，自己的瞳孔泛着幽蓝幽蓝的光。她好友阿桑瞧见了，吓得直往后退，指着她脖颈上青紫色的斑痕说，这跟唐卡背面用藏文写的“卓玛”俩字一模一样。
碧如莫心里害怕，带着唐卡就去了拉萨的一座古寺。活佛伸手一摸那画布，好家伙，七窍立马就开始流血，没一会儿就没气儿了。经阁里的老喇嘛哆哆嗦嗦地翻出《十万黑经》，上面写着，百年前有个画师叫卓玛，因为不肯给贵族画诅咒唐卡，被人剥皮做成了“人皮唐卡”，她临死的时候，把骨灰混在颜料里写了个血咒。这时候，唐卡上的度母眼珠子突然就转了，窗外的经幡没风自己就动起来，十二尊护法像齐刷刷地低下了头。
有个暴雨夜，碧如莫正睡着呢，被唐卡传来的撕扯声给惊醒了。她一瞧，画布上又开始重演卓玛被剥皮的场景，更邪门的是，那行刑的人，长得跟古寺那个死了的活佛一模一样。这时候，她手臂上的血管突然就爆裂了，鲜血喷在墙面上，画出一个跟唐卡同源的曼陀罗图腾。第二天新闻报道说，活佛圆寂那天晚上，偷偷跑去一个凶宅做法，现场还发现了用血画的献祭阵。
碧如莫发现，自己血管上的纹路跟唐卡图案一起长，一到午夜，她就能感觉到卓玛被剥皮时候的痛苦。她顺着幻觉找到了当年剥皮的石屋，在墙缝里挖出半截沾满朱砂的指骨。她一碰到那指骨，卓玛临死前的记忆就像潮水一样涌进她脑袋里。原来，是那个活佛为了夺取镇寺之宝，诬陷卓玛用邪术，还把她的情人做成“伏魔桩”埋在地基里。
从这以后，古寺里就怪事不断。僧人莫名其妙地自燃成灰，转经筒里渗出脓血，佛像也集体流泪。碧如莫的血管全变成金绿色了，她的血滴到枯树上，枯树都能开花。她还梦见卓玛的皮囊变成唐卡，把活佛裹住，一起沉到地底下去了。第二天，古寺的地宫就崩塌了，考古队发现，活佛的遗骸被九根刻满咒文的铁钉贯穿四肢和七窍。
这时候，碧如莫有了“血瞳”的能力，能看见空气中飘着的怨灵。她看见卓玛情人的魂魄被困在寺钟里，每敲一下钟，都能听见他的惨叫。她一狠心，割破手指弹出三滴血，那钟“哐当”一声就裂开了，青烟凝聚成一个俊美的青年。这青年怒吼着就冲向经阁，把记载活佛功德的金册全烧成灰了。
一场暴雨引发山体滑坡，古寺的地基露出来，下面是用三百具童男童女尸骨奠基的“人骨坛城”。碧如莫的血管突突直跳，唐卡自己就展开，形成一个结界。地底传来闷响，卓玛情人的尸骨从土里冒出来，肋骨间缠着的，正是当年包卓玛人皮的唐卡。这时候，碧如莫七窍开始渗血，她把最后半瓶朱砂泼向天空，漫天血雨中浮现出十万冤魂的虚影。
古寺在怨灵的哭嚎声中塌成一片废墟，碧如莫站在唐卡中央，慢慢升上天空。她的血肉就像颜料一样渗进画布，跟卓玛的魂魄合二为一了。新上任的活佛一看，废墟里升起的绿度母唐卡变样了：度母的脸是碧如莫和卓玛的合体，手里拿的莲花是用活佛头骨雕的，莲台是三百冤魂凝聚成的光轮。
三年之后，古寺重建好了，供奉着新的“血色度母”唐卡。有朝圣的人发现，要是用晨露擦画布，会浮现出碧如莫血管的纹路。唐卡的右下角，还隐隐约约能看见两行血字：“血债血偿，轮回不灭”。有个雨夜，守殿的喇嘛听见唐卡里传来卓玛和碧如莫的笑声，一转头，就看见满墙的经幡没风自己动起来，织出万千血色曼陀罗，那场面，谁见了不害怕呀！