朱载坖明确给内阁、部院和中外衙门下达诏令，日后太子令旨效力等同于上谕，同时太子批阅奏疏和朱载坖一样，加盖禹斋私印和朱载坖的舜斋私印是一样的，明确赋予太子批答奏疏的权力，进一步的提高了太子了权力，尽管内阁对此提出了一些意见，但是朱载坖都以圣躬违和为由，予以拒绝了。
而在将政务交给太子之后，朱载坖和郑王一道视察了格物院、文思院，做为现在大明最重要的科研机构，朱载坖从即位以来就对这两个机构投入巨资，招揽人才，使得大明能够在科技上保有优势，对于大明来说，保持科技的领先是极为重要的事情，朱载坖在这个问题上也是很重要的。
所以这次朱载坖专门和郑王朱载堉、军器监赵士祯等人一道视察大明的这些科研机构，根据朱载坖对于大明这些科研机构的分工，格物院主要是负责理论研究，等文思院则是负责将这些理论加以应用，所以朱载坖首先就是来到了格物院，现在的格物院，主要就是三个大类的研究。
其一是物理，主要包括力、热、声、光等科目，大明在力学和光学上已经有了一些进展了，并且将其应用到大明的实际生产中，如蒸汽机和轨道交通工具等的生计。
其二是化学，现在大明的化学尚处于比较初步的阶段，仅仅按照酸碱等进行了简单的分类。
其三就是天文与算学，因为朱载坖之前将钦天监也划入了格物院管理，所以现在天文和算学都已经合并在了一起，因为算学对于天文和物理的推动作用是极大，对于朝廷来说算学也是有极为重要的意义了。
朱载堉汇报了现在情况，在物理层面，大明的进步是最大的，由于朱载坖自己提出了皇帝三定律，而格物院就可以凭借这个演绎出一整套的经典物理体系，同时在光学领域也是有所进步的，对于光的折射等有了足够的研究，对于朝廷各种光学器材的改进都是有极为重要的意义了。
但是在化学上尚处于摸索的阶段，尽管朱载坖也提出了一些观点，如有关元素，通过对多种化学反应的研究，发现了一些基本物质在反应中保持不变，这些物质就应该被称为元素，元素已经不可再分，还有就是三酸两碱的重要性，这点其实格物院是很清楚的。
不过朱载坖认为化学是需要大量的实验来证明的科学，只要能够持续投入，终究是能够找到门路的，其实格物院也已经通过浓硫酸和硝石反应得到了硝酸，但是这种硝酸极不稳定，而且浓度不够，只是处于研究阶段，不管对于朱载坖来说，这就完全足够了，因为硝酸、酒精和水银这三种东西在一起，可以得到一个朱载坖朝思暮想的东西。
除此之外，还要煤化学和盐化学，就是对于煤炭炼焦中的分成和盐卤中的成分予以研究，朱载坖对于此事也是极为支持的，朱载坖的态度就是放任研究，所需的款项由内帑支出，只要由成果就好。
除了格物院之外，文思院和军器监也是朱载坖视察的重点，文思院是大明重要的科研和工程机构，汇聚了大明的能工巧匠，对于大明来说是有极大的作用的，最近文思院的主要工作就是改装、改进大量的机械，使得大明的各种机械能够使用蒸汽动力。
除此之外就是为了应对大名现在日益庞大的基础设计建设，朱载堉也奏请设立专门的工程研究所，专门负责各种土木工程、桥梁、堤坝、要塞、官军工事的研究、建造等，这点也得到了朱载坖的同意，命令文思院草拟奏疏上陈之后由朱载坖批复。
朱载坖的重头戏自然是军器监，现在大明官军正在大规模的换装，军器监在其中承担了极为重要的作用，这次不仅仅是大明官军军器更新换代，更加重要的是大明官军战术的一次革新，朱载坖在各军机处商量之后，决定在大明官军步卒中全面淘汰冷兵器，以火铳作为官军的主要武器，使得官军实现火器化，对于朱载坖的这个要求，很多大将是不能理解的，他们仍旧认为冷兵器是有一定作用的。
所以朱载坖和军机大臣们一道亲自视察军器监，同时就是现在军器监所生产的火器进行再次的评估与测试，这次在朱载坖的干预下，使用了后膛装弹的设计，虽然使得火铳成本和加工生产难度提升，但是确实提高了火铳的射速，之前官军无法淘汰冷兵器的主要原因就是火器的射速低，往往不能够利用火器将敌人击溃。
官军的打法往往是以火器杀伤敌人，挫伤其锐气之后，在以白刃突击彻底击溃对手，但是在射速提高之后，官军的火力密度得到很大的提升，同时后膛装填的设计允许士兵在更隐蔽的姿态（如卧姿）下快速装填，避免了前膛枪必须站立、从枪口逐次倒入火药和弹丸的繁琐流程。这使得其理论射速可达?每分钟7-9发?，远超前膛滑膛燧发枪通常的每分钟2-3发。
这种进步使得官军可以采取更加灵活的战术，比如堑壕等就是官军日后步兵作战的一大重点了，同时后膛装填火铳在精度上也有一定程度的提升，朱载坖抽取羽林军随机一连士卒齐射，在三十丈的距离上对人形靶标的命中率达到四成，确实是比之前要好多了。
当然后膛装填也要求士卒素质上升，同时加工的难度也远超之前，同时士卒们也反应开火时漏气和后坐力过大的问题，这点是军器监下一步的问题，除了火铳、火炮之外，还有就是水师战舰的问题了，一直以来，朱载坖和大明水师的重点都在大型战舰上，因为朱载坖一向认为必须建立一支庞大而有威慑力的主力舰队，才能够保证大明领海不受侵犯，但是除了这些大型舰船之外，中小型的战船也是极为重要的。