申时行是状元出身，首辅之尊，明确拒绝了担任制科考官一事，就使得此事在朝廷上下感到震惊，以申时行的才学和资历，如果真的要想谋求制科考官这一职务的话，是极为容易的，但是申时行却选择了直接上疏朱载坖，表明了自己的想法。
申时行的看法是很简单的，他在奏疏中详细列举了自己不能担任制科考官的原因，第一就是自己不以经义见长，而本次的制科，乃是博学宏词科，所需要的是长于经义，博学多才的臣子，而自己常年埋头案牍，远离书本，学问没有长进，不配担任制科考官。
第二点就是要避嫌，现在大明的士子们都很清楚，一旦取中制科，那就是进入了升官的快车道，比之翰林院还要得到重用，部堂督抚都是等闲，所以制科在大明是极为受到追捧的，自己本就是首辅，如果再担任制科考官的话，未免不被人视为在培植党羽。
身处嫌疑之地，就更要立身持正才行，而且即便是自己不会利用担任制科考试考官的职务之便为自己培植党羽，但是只要自己的考官，那么所取中的制科考生必然会被人认为是申时行的党羽，所以为了避嫌，申时行认为自己不能够担任考官。
除此之外，申时行认为首辅是辅佐天下，治理天下的，重心应当放到政务上来，而不是参与这些考试，基于这三个理由，申时行认为自己不应当担任制科考官，对于申时行的奏疏，朱载坖予以同意，同时还赏赐申时行彩币、酒肉和蟒衣，以示恩宠。
申时行以这种方式将很多重臣谋求担任制科考官的道路给堵死了，同时将选拔制科考官的大权上收到朱载坖手中，朱载坖自然是要对申时行投桃报李的，申时行很清楚，自己担任首辅时间已经不短的，即便是在隆庆朝提倡阁臣久任的情况，自己的任期也已经到了要结束的时候的，所以越是在这个时候，越是要和朱载坖搞好关系，揣摩朱载坖的心思，给皇帝留下好印象，这样对于自己致仕之后和子孙后代都是有极大的好处的。
朱载坖这人有一个好处，就是对于有功劳的臣子，其子孙要是有能力的话，必然得到重用，即便是没有能力，朱载坖也会安排闲职，保其富贵，这也算是朱载坖和重臣们的一种默契吧，所以申时行在朱载坖提出开制科的时候就想到了此事。
这次的制科，不同于以往，这次开设博学宏词科的主要目的，是为了朝廷编撰经义、史学教材，对于朝廷来说，是关系到百年大计的事情，朱载坖肯定是要极为重视的，首先就是要选拔出有真才实学的人来，这点是极为重要的，只有这样，才能够保证朝廷所编撰出来的教材能够使得朝野上下都能够满意。
否则话，编撰出来的教材错漏百出，那就打的不仅仅是大明朝廷的脸面了，而是朱载坖这个皇帝的脸面了，所以这次制科最重要的就是要选拔出优秀的人才，才能够保证大明编撰教材的质量，这点是最重要的事情，申时行很清楚朱载坖对于此事的重视，不惜通过开设制科来为编撰教材选拔人才，是务必要办好此事的。
申时行认为首先要做的就是排除政治干扰，尤其是重臣们对于此次制科的干扰，所以申时行首先以自己开刀，明确表示自己不能参与此次制科考试，而在申时行之后，次辅王锡爵也上疏称自己科名不如申时行，申时行尚且自认没有能力担任考官，那自己就更没有可能了。
因为申时行是嘉靖四十一年的状元，而王锡爵是嘉靖四十一年的榜眼，首辅和次辅相继表态之后，内阁辅臣和部院重臣们也都纷纷上疏，认为不能担任制科考官。
朱载坖收到这些奏疏之后不禁笑着对太子说道：“人皆以充任考官，司职抡才为荣，今满朝重臣，竟皆不愿充任考官，申阁老倒是帮了朕大忙啊。”
朱载坖当然知道申时行的问题，君臣两人在这个问题是很有默契的，制科乃是朝廷最重要也是等级最高的考试，朝廷是必然要遣重臣充当考官的，但是现在在申时行的带动之下，阁部重臣们都纷纷上疏表示不能担任考官，这样选择的大权就完全在朱载坖的手上了。
申时行这一招确实是非常之高明的，以身为饵，现在估计很多部堂大员们都在背后骂申时行呢，自己不想当就算了，连累大家都没得搞，朱载坖问太子：“现今重臣之中，何人可以知贡举啊。”
这点太子也是在思考的，太子中意的是陈于陛，因为陈于陛少从父陈以勤习国家故实。为史官，益究经世学。在经史方面的造诣颇高，同时负责编修国史，陈以勤不仅仅是朱载坖的讲官，也是大明的藏书大家，陈于陛在阁臣之中，也算是博学多才的，所以太子认为，陈于陛算是不错的人选。
朱载坖并没有立即予以回答，而是要求在京官员先举荐同考官，相比于主考官，同考官的要求肯定是要低一些的，主要是在资历和品级上的要求可以放宽，但是由于是制科，还是制科中最为重要的博学宏词科，所以对于同考官的要求也是很高的。
主要以翰林出身的官员为主，这点确实大明官场的潜规则，就是一切重翰林，因为大明朝廷的鄙视链就是主要根据科名而来的，制科出身太少，不是官场主流，其他的各种出身，举人出身的看不起吏员考选的，进士出身的自然是看不起举人出身，而翰林院庶吉士出身，不好意思，在坐各位都是乐色，平等的看不起其他所有出身的。
尤其是在制科这么重要的事情上，自然是要首重翰苑的，所以一些在翰林院中才名比较出众的官员被举荐了出来，成为同考官的候选人。