公元一二二零年三月底，蒙古各路大军会师于不花剌城以东二百余里、撒马尔罕以北一百余里处的一处山地，系克孜尔库姆沙漠的南部边缘。
克孜尔库姆沙漠在锡尔河与阿姆河之间，由东南向西北倾斜。沙垄广布，有新月形沙丘，还有一系列封闭盆地和孤山，只生长沙漠植物，有几个小绿洲居民点。
蒙古大军会师以后，要做的第一个事情，就是遵照成吉思汗命令，处死海儿汗！
窝阔台命人将已经奄奄一息的海儿汗押到汗帐前面的空地上，然后从怀里取出几两银子，对海儿汗说，你不是很喜欢钱吗？把这些银子吃掉，我就不杀你了。
海儿汗紧闭双眼，一言不发。
窝阔台说，你如果不愿意吃，我也不勉强你。
窝阔台命人生起柴火，支起行军锅，将那几两银子融化成银水。
窝阔台把银水倒进木碗里，拿着勺子，来到海儿汗身边，通过翻译对禁闭双眼的海儿汗说，你不是曾经为了钱而杀死我们五百名蒙古商人吗？汉人有句话叫见钱眼看，我给你送钱来了，还不睁眼？
海儿汗刚才已经虚着眼睛看着蒙古人在熬银水了，也猜到窝阔台要干什么，所以十分害怕，不敢睁开眼睛。
窝阔台命人按住海儿汗的脑袋，掰开他的眼睛，把融化的银水一点一滴的滴入他的眼睛。海儿汗十分痛苦，撕心裂肺的大声叫喊，不过没有好久，就叫不出来了。
窝阔台滴了一会儿，把碗拿给身边的侍卫说，给我慢慢的滴，滴上一个时辰。
自私贪婪的海儿汗就这样被折磨一个时辰后，痛苦的死去了。
处死海儿汗后，成吉思汗命令全军就地安营扎寨，一边休整，一边清点伤亡。
经过清点，让成吉思汗大吃一惊，他没有想到还没有和花剌子模进行决战，有将近十万的蒙古士兵已经埋骨他乡。其中右路军损失最为惨重，因为遭受讹答剌城守军和帖木儿蔑里的英勇阻击，蒙古骑兵战死一万余人，攻城步兵战死三万余人，就连后勤步兵也战死两万余人。
此时驻扎克孜尔库姆沙漠的蒙古骑兵仅八万余人马，攻城步兵和重兵器车兵五万余人，后勤步兵七万余人。另外在攻打花剌子模中部、东部、北部地区时，蒙古大军也收降了十万余降兵，但后来死的死、逃的逃，已不足万人。
原本计划四月初就准备攻打撒马尔罕的成吉思汗，只得改变作战计划。
成吉思汗首先亲笔拟诏，通过三十里一处的驿站发往大蒙古国汗庭，让哈萨尔从预备军中征召两万骑兵，并立即送至撒马尔罕前线。
成吉思汗又写了两道诏书，一道发给中原地区的木华黎，请他派会制造火药火炮的技师到虎耳朵指导耶律不花研发、制造火药火炮。一道发给驻守于虎耳朵的耶律不花，请他派人在木华黎所派技师的指导下就近研发、制造火药火炮，制好以后马上送至撒马尔罕。
成吉思汗又派人分别返回花剌子模中部、东部、西部地区，到被征服的城池去征集士兵，征到的新兵全部编入攻城步兵，原来的一些攻城步兵则选择年龄大的编入后勤步兵。
郭宝玉对成吉思汗说，臣在忽毡城前的锡尔河和花剌子模大将军帖木儿蔑里交战时，见其将铁甲盖于船上，成为“铁甲战船”，能起到很好的防御作用，因此臣想，我们的后勤部队押运大量的马车走在队伍，现在我军深入敌境，万一偷袭敌军偷袭我军后勤部队，一旦断我粮草，我军就十分危险，因此臣建议，可为我们的后勤马车也批上一层铁甲，这样不但可以起到防御作用，后勤步兵还可以藏在马车后面，对敌军进行阻击。
成吉思汗说，你这个建议很好，我即刻命令失吉忽秃忽派人到附近城池收集铁皮，打造我们的“铁甲战车”。
成吉思汗同时命令博尔术带着工匠万人队制造更多的重兵器车，并修补已经破损的重兵器车。