五帝时代落幕，又历千年光阴。
这千年间，人族气运愈发浑厚，火云洞三皇气息交织，护佑人族安居乐业，文明之火愈发旺盛。可洪荒天地间，劫气却已浓郁到近乎实质——三皇出世时的功德虽盛，却难掩涿鹿之战的杀伐戾气，再加上人皇传承中各方势力暗插因果，无数杀业交织缠绕，化作漫天黑雾，笼罩在昆仑山脉、碧游宫等仙山圣地之上，隐隐引动天道警示。
阐教十二金仙的处境愈发艰难。杀劫缠身，他们道行停滞不前，周身煞气日渐凝重，连玉虚宫的清净仙气都难以化解。广成子自境界跌落至大罗金仙中期后，数次闭关冲击，非但未能精进，反而因煞气反噬，道基险些受损；其余金仙也各有困扰，或心魔滋生，或法宝蒙尘，往日仙风道骨的模样荡然无存。
元始天尊立于玉虚宫山巅，望着漫天翻滚的劫气，又看向殿内弟子们狼狈的模样，怒火再也压抑不住。他身影一动，便已出现在通天教主的碧游宫前，不等守门弟子通报，便径直踏入殿内。
此时通天教主正与众弟子论道，殿内仙气缭绕，却也难掩部分弟子身上的驳杂气息——截教广收门徒，有根脚深厚的先天神只，也有草木成精的妖仙，更有披毛戴角之辈，良莠不齐确是事实。
“师弟！”元始天尊沉声开口，语气中满是不满，“你看看如今洪荒劫气何等浓郁！我阐教弟子因涿鹿之战沾染杀劫，已是苦不堪言，而你截教门下，鱼龙混杂，良莠不齐，不少弟子在外惹是生非，更添杀业，让昆仑山上乌烟瘴气！你若再不严加管束，迟早要连累整个三清道统！”
通天教主闻言，眉头一蹙。他深知截教门人的情况，却不喜元始天尊这般盛气凌人的指责，当即反驳：“师兄此言差矣！我截教教义，本就是‘有教无类’，顺应天道自然，众生皆可修行。我门下弟子虽根脚各异，却也多有向善之心，何来‘乌烟瘴气’之说？杀劫降临，乃是天道定数，岂能全怪我截教弟子？”
“哼！有教无类？”元始天尊冷笑一声，“你看看那些披毛戴角、湿生卵化之辈，岂能登大雅之堂？他们四处张扬，惹下无数因果，如今劫气缠身，你我都难辞其咎！我劝你即刻清理门户，只留根脚纯正之辈，否则日后必遭大祸！”
“师兄是嫌我弟子出身低微，丢了三清的脸面？”通天教主眼中闪过一丝怒意，“修行之道，重在心诚，而非出身！你阐教自诩根脚纯正，却也未见得个个都是良善之辈，广成子为助轩辕，斩杀无数巫人，杀业难道还少吗？如今反倒来指责我截教！”
二人各执一词，争吵愈发激烈。元始天尊素来高傲，见通天教主不肯服软，更是怒火中烧，言语愈发尖锐；通天教主性情刚直，受不得这般指责，心中也生出嫌隙。
“罢了罢了！”通天教主猛地一甩袖子，周身仙气激荡，殿内众弟子皆噤若寒蝉，“师兄既如此看轻我截教，看轻我门下弟子，我也不便再与师兄同驻昆仑！从此往后，三清道统各归各路，你我各守一方，再无牵扯！”
话音落下，通天教主不再看元始天尊一眼，转身对众弟子朗声道：“收拾行装，随为师另立道场，寻一处真正能容得下众生修行之地！”
众弟子虽有惊愕，却也不敢违抗师命，纷纷领命而去。通天教主最后看了一眼昆仑山脉，眼中闪过一丝复杂，随即化作一道金光，带着弟子们破空而去，直奔东海金鳌岛。
元始天尊望着通天教主离去的背影，怒气未消，却也并未阻拦。他冷哼一声，转身返回玉虚宫，心中暗忖：这般不知好歹，日后劫气爆发，自有你好受！
而此时，老子正静坐于八景宫，将二人的争吵听得一清二楚。他轻叹一声，摇了摇头。三清本是一体，如今却因教义之争、弟子之故心生嫌隙，实在非他所愿。只是他素来清静无为，不愿卷入纷争，又见昆仑山上劫气浓郁，已非清净之地，遂起身收拾行囊，带着玄都弟子，悄然离开了昆仑，前往西方函谷关，寻了一处山谷开辟道场，闭门修行，不再过问三清纷争。
一夜之间，三清分家。
昆仑山脉之上，只剩下元始天尊的阐教一脉。玉虚宫依旧巍峨，却少了往日的热闹，多了几分冷清。元始天尊立于山巅，望着空荡荡的昆仑，心中虽有不甘，却也更加坚定了日后清算截教的念头。
而远在不周山的昊天，早已通过太白金星的密报知晓了昆仑山上的变故。他立于凌霄宝殿之巅，望着昆仑方向，嘴角勾起一抹淡淡的笑意。三清分家，三教矛盾彻底公开化，这正是他乐于见到的局面。
此刻的昊天，已稳固混元金仙后期境界，周身道韵圆融，他看着漫天浓郁的劫气，又看向金鳌岛、函谷关、玉虚宫三个方向，眼中闪过一丝精光：“三清分家，劫气成熟，道祖降下封神榜之日，已然不远了。太白金星，密切关注三教动向，有什么风吹草动，，随时向朕禀报。”
太白金星领命而去。洪荒天地间，三清分家的消息迅速传开，各方势力皆暗流涌动。老子不问世事，截教在金鳌岛立稳脚跟，广收门徒，势力愈发庞大；阐教闭门修行，暗中积蓄力量；西方二圣则趁机招揽散修，壮大西方教；