江南苏杭府的富商毒杀案，因格物大学堂毕业生王睿的毒物检验而峰回路转，真凶——一名能接触到药材的贴身仆役最终认罪伏法。此案虽已了结，但其引发的波澜，却刚刚开始向帝国的司法体系深处扩散。
案件卷宗连同王睿的检验记录被呈送刑部，立刻引起了轩然大波。
都察院几位以卫道自居的御史，联名上奏，措辞激烈：“苏杭府案，倚仗器测之术定谳，开千古未有之恶例！夫刑名者，皋陶相传，春秋决狱，重在明刑弼教，观其心迹。今若以瓶罐反应断人生死，置《大明律》之‘五听’（辞听、色听、气听、耳听、目听）于何地？长此以往，胥吏持奇技以弄权，酷吏借器测以罗织，国法荡然，人心危惧！”
奏章如同投入平静湖面的巨石，在朝堂上激起了巨大的争论。支持者则认为，器测之术能“格物致知”，探求真相，使真凶难逃，无辜者得雪，正是“明刑”的体现。
一直静观其变的高拱，此次也未保持沉默。他在内阁议政时，持重地言道：“苏杭之案，结果虽善，然过程可虑。刑狱关乎人命，岂能尽付于未经验证之新法？若推而广之，天下刑名皆效仿此道，恐失之毫厘，谬以千里。老夫以为，当慎之又慎。”
压力，再次汇聚到林凡身上。
面对汹汹物议，林凡没有强行辩驳，而是再次祭出了他屡试不爽的策略——试点。
他向皇帝上了一道长长的奏疏，并未直接为“器测”张目，而是从“恤刑慎罚”、“泽及无辜”的仁政角度切入：
“陛下，臣闻古之圣王治狱，求其生而不得，则死者与我皆无恨也。然人之智慧有限，冤假错案，古今难免。今有格物之法，或可于纷繁线索之外，另辟蹊径，佐证案情，以补人力之穷。若因其新而一概斥之，恐失明明德、恤民命之本心。”
他恳请皇帝，恩准在刑部之下，设立一个级别不高、但权责清晰的“刑名格物检验所”，并选择南北各一省进行试点。检验所仅负责接受委托，对物证进行检验分析，出具“格物检验文书”，其结论仅作为审案参考，不具备直接定罪的效力，最终裁决仍牢牢掌握在主审官手中。
同时，他建议由刑部、都察院、大理寺三法司与格物大学堂共同拟定《刑名格物检验暂行章程》，对检验项目、方法、文书格式进行严格规范。
这是一个极其谨慎而务实的方案，既回应了保守派的担忧（不剥夺法官权力），又为新方法打开了一道门缝。皇帝权衡再三，最终朱批：“依议。着该部堂详议章程，务求稳妥，试行以观后效。”
“刑名格物检验所”在京城一个不起眼的偏院内挂牌成立。王睿因苏杭府案的表现，被调任为首批检验员之一。然而，成立之初，门庭冷落。
各地刑名官员大多持观望态度，不愿轻易将案件的关键证据送来检验，生怕惹上“标新立异”、“依赖奇技”的非议。偶尔送来的，也多是一些无关紧要、或早已定论的陈年旧案，意在试探。
检验所内，王睿和他的同僚们并不气馁。他们利用这段空闲时间，反复演练各种检验流程，完善文书档案，甚至主动向刑部的老仵作、老书吏请教传统验伤、辨迹的方法，试图找到新旧之间的结合点。
“我们不能等着案子送上门，”王睿对同伴们说，“我们要让所有人看到，我们的‘器测’，是为了让‘五听’更准，让律法更公！”
这段时间，林凡回府更晚，眉宇间常带着思虑。顾莲舟细心察觉，并未多问，只是将书房整理得更加舒适，宵夜准备得更加精心。
一日，林凡在书房看到长子林怀瑾（安儿）正在阅读一份关于司法检验的争论文章，便随口问了他的看法。
林怀瑾放下文章，认真答道：“父亲，孩儿以为，律法之目的，在于止争定分，惩恶扬善。若格物之法能更接近真相，便与律法精神无异。然其推行之难，在于人心非是算学公式，无法全然用数字衡量。如何取信于人，或比技术本身更为关键。”
林凡欣慰地点点头。儿子的思考，已然触及了问题的核心——技术易得，信任难建。
转机出现在一桩看似普通的民间斗殴致死案上。京城两名纨绔子弟当街争执，一人被推搡倒地，后脑磕碰石阶，不治身亡。现场目击者众多，皆言是意外失手。苦主家却坚称是故意谋杀，并买通数人作伪证。
案件审理陷入僵局。主审的刑部郎中不胜其烦，抱着死马当活马医的心态，将死者衣物、现场石阶的刮擦样本等，送到了冷冷清清的“刑名格物检验所”。
王睿接到任务，极其慎重。他与同伴们仔细检验了衣物上的磨损痕迹与石阶的棱角，进行了受力分析模拟，甚至复原了当时的碰撞角度。最终，他们出具了一份详细的检验文书，结论倾向于是意外滑倒导致的致命撞击，与故意推搡致死的痕迹特征存在明显差异。
这份文书送到刑部，顿时引起了更大的争议！苦主家背后亦有势力，指责检验所“收受贿赂，妄断案情”。案件一下子从普通的刑案，升级成了关乎“检验所”存废的风向标案件。
夜色深沉，林凡站在窗前，听着赵虎汇报检验所面临的新压力。
“告诉他们，”林凡的声音平静而坚定，“秉公办理即可。证据如何，便如何说。此案，或许正是打破僵局的那块石头。”
他知道，司法改革的道路上，从不缺少风波。而真正的基石，正是在这一次次的风波与考验中，凭借无可辩驳的事实与严谨的程序，一砖一瓦地奠定起来的。
“刑名格物检验所”这叶小舟，已被推到了风口浪尖。下一章的走向，将取决于这场看似普通的斗殴案，如何在大晟最高司法权力的注视下，演变为一场决定新旧法理命运的关键对决。