青年共生舰队在边缘星域的出色表现，让联盟的影响力延伸到了宇宙的各个角落。但就在王共生带领舰队前往一个名为 “暗尘星系” 的边缘星域时，一场新的基因危机突然爆发。
暗尘星系的环境恶劣，星系内布满了宇宙尘埃，光线昏暗，生物的基因都具有很强的适应性。但最近，星系内的多个文明突然出现了基因崩溃的现象 —— 生物的基因链快速断裂，身体逐渐分解，死亡速度极快，没有任何治愈的迹象。
王共生带领舰队抵达暗尘星系后，立刻对感染的生物进行基因检测。检测结果让所有人都感到震惊：导致基因崩溃的，是一种名为 “虚空基因虫” 的生物。这种虫子体型微小，能够穿透生物的皮肤，进入体内后快速繁殖，吞噬生物的基因链，导致基因崩溃。
“虚空基因虫不是自然形成的，是人工培育的基因武器！” 舰队的基因专家分析道，“它们的基因序列中，含有暗影基因帝国的残留片段，可能是帝国的余孽在暗中搞鬼。”
这个发现让王共生的脸色变得凝重。暗影基因帝国虽然已经覆灭，但仍有部分残余势力潜伏在宇宙的各个角落，试图卷土重来。
虚空基因虫的传播速度极快，已经感染了暗尘星系的三个文明，超过十万生物死亡。王共生立刻联系联盟总部，向父母汇报情况。
“虚空基因虫的核心弱点是害怕本源基因的能量。” 王屿辞通过通讯器说道，“你可以利用舰队的基因共振武器，调整频率为本源基因的能量频率，能够有效杀死虚空基因虫。同时，用强化共生基因的净化能力，修复被感染生物的基因链。”
林悦补充道：“还要尽快找到虚空基因虫的培育基地，摧毁它们的繁殖源头，否则危机将无法彻底解决。”
王共生按照父母的指示，立刻行动。他下令舰队的飞船同时发射本源基因频率的共振能量束，覆盖感染区域。虚空基因虫在能量束的作用下，纷纷死亡，被感染生物的基因崩溃速度明显减缓。随后，舰队的医疗小队带着便携式净化设备，深入各个文明，修复被感染生物的基因链。
在治疗的同时，王共生带领精英小队，开始寻找虚空基因虫的培育基地。根据基因虫的传播轨迹，小队最终锁定了暗尘星系边缘的一颗废弃行星。这颗行星的表面布满了洞穴，洞穴内隐藏着巨大的生物培育舱，里面培育着大量的虚空基因虫，还有几名穿着黑色斗篷的暗影帝国余孽在操作设备。
“发起攻击！摧毁培育舱！” 王共生下令。
精英小队的成员激活强化共生基因，朝着洞穴内的余孽发起攻击。暗影余孽也激活了残留的暗影基因，释放出黑色的能量，与小队成员展开战斗。这些余孽的实力不容小觑，小队成员一时难以取胜。
“使用本源基因共鸣！” 王共生喊道。他激活自身的本源基因片段，释放出淡金色的能量，与小队成员的基因能量连接在一起。淡金色的能量形成了强大的攻击波，击中了暗影余孽，余孽的身体瞬间被净化，化为灰烬。
解决掉余孽后，小队成员摧毁了所有的培育舱，彻底切断了虚空基因虫的繁殖源头。
暗尘星系的基因危机终于得到了解决。星系内的文明首领联合向联盟总部发送感谢信，称赞青年共生舰队是 “黑暗中的光”。
但王共生知道，这只是暗影帝国余孽的一次试探。根据俘虏的一名余孽供述，暗影帝国的残余势力组建了一个名为 “暗影复辟组织”，在宇宙的边缘星域潜伏，培育各种基因武器，试图颠覆联盟的统治，重建暗影帝国。
“我们必须尽快铲除暗影复辟组织，否则他们会带来更大的危机。” 王共生向父母建议。
王屿辞和林悦同意了儿子的建议。联盟总部立刻下令，派遣联合舰队前往边缘星域，与青年共生舰队汇合，展开对暗影复辟组织的清剿行动。
王屿辞亲自带队，林悦负责技术支持。父子二人并肩作战，成为了联盟舰队的核心指挥。在接下来的一年里，联盟舰队在边缘星域展开了大规模的清剿行动，摧毁了暗影复辟组织的多个培育基地，抓获了大量的余孽，彻底瓦解了暗影复辟组织的势力。
清剿行动结束后，王屿辞看着儿子成熟的脸庞，欣慰地说：“你已经成为了一名真正的宇宙基因守护者。”
王共生恭敬地说：“这都是父亲母亲的教导，我还有很多需要学习的地方。”
这场边缘星域的基因危机，不仅彻底清除了暗影帝国的残余势力，还让联盟的凝聚力和影响力进一步提升。宇宙的基因和平，得到了更牢固的保障。