经过一个月的航行，舰队终于抵达了宇宙基因网络枢纽的外围。眼前的景象让所有人都感到震撼：枢纽是一颗直径约一千公里的淡金色能量星体，无数宇宙基因网络的丝线从星体延伸出去，如同宇宙的心脏，源源不断地向各个星系输送本源基因能量。但在枢纽周围，却笼罩着一层厚厚的暗灰色能量云，无数影蚀生物在能量云中穿梭，形成了一支庞大的 “影蚀军团”，守护着枢纽，阻止任何人靠近。
“影蚀军团的规模远超我们的想象，至少有上百万只影蚀生物。” 艾拉的深层感知扫过能量云，语气凝重，“它们的核心是‘影蚀领主’，位于能量云的中心，正是它在操控整个军团。”
克里尔调出影蚀军团的三维模型：“能量云的密度很高，我们的舰队无法直接穿透，必须先撕开一道缺口，让多元共生者团队进入枢纽内部。”
王共生做出部署：“联合舰队分为三个梯队，第一梯队由光族舰队和水晶文明舰队组成，利用光线能量和硅基能量，撕开能量云的缺口；第二梯队由岩晶文明和雾隐文明舰队组成，负责掩护第一梯队，抵御影蚀生物的袭击；第三梯队由‘溯源号’带领，在缺口打开后，护送多元共生者团队进入枢纽。”
行动开始后，第一梯队的舰队同时发起攻击。光族舰队释放出密集的白光，穿透暗灰色能量云，形成一道道光柱；水晶文明舰队发射硅基能量束，击中能量云的薄弱区域。能量云剧烈波动，暗灰色的能量与光线、硅基能量碰撞，爆发出巨大的能量冲击波。
“缺口打开了！直径约五十公里！” 光族舰队的队长喊道。但就在这时，能量云突然沸腾起来，上百万只影蚀生物从能量云中冲出，朝着第一梯队的舰队发起攻击。这些影蚀生物形态各异，有的如同巨大的影子，有的如同细长的触手，能穿透飞船的防护盾，侵蚀船体的基因结构。
“第二梯队，掩护！” 王共生下令。岩晶文明的舰队释放出岩石能量，在第一梯队周围形成厚厚的岩石护盾；雾隐文明的舰队释放出迷雾，让影蚀生物的视线受阻，同时用雾能攻击影蚀生物，暂时压制它们的行动。
但影蚀生物的数量太多，岩石护盾很快被侵蚀出无数缺口，几艘光族飞船的防护盾被影蚀生物突破，船体开始被暗灰色能量侵蚀。“这样下去不是办法，我们的能量消耗太快了！” 光曦焦急地说。
王承平知道，必须尽快解决影蚀领主。他对多元共生者团队说：“你们跟我一起，乘坐穿梭舱冲进能量云，直接攻击影蚀领主。只要解决了它，影蚀军团就会失去指挥，不攻自破。”
“速修号” 穿梭舱快速冲出舰队，朝着能量云的中心飞去。影蚀生物察觉到了他们的意图，纷纷转向拦截。艾拉释放星核能量，形成淡绿色的防护盾，挡住影蚀生物的攻击；岩峰操控岩石能量，在穿梭舱前方开辟道路；雾纱释放迷雾，掩护穿梭舱前进；光曦释放纯粹的光线能量，净化掉靠近的影蚀生物。
穿梭舱艰难地穿过影蚀生物的拦截，终于抵达能量云的中心。这里的暗灰色能量浓度最高，一只巨大的影蚀生物悬浮在中央 —— 它的体型如同一座小山，身体由无数缠绕的暗灰色触手组成，核心处有一颗黑色的 “影蚀核心”，正是影蚀领主。
“就是现在！同步能量！” 王承平大喊。多元共生者团队同时将各自的共生基因能量注入王承平体内。王承平的身体爆发出耀眼的淡白色光芒，纯粹的多元共生能量从他体内释放出来，形成一把巨大的能量剑。他操控能量剑，朝着影蚀领主的核心斩去。
影蚀领主发出一声刺耳的嘶吼，释放出暗灰色的能量波反击。但纯粹的多元共生能量是影蚀生物的克星，能量波接触到淡白色光芒后，瞬间被净化。能量剑精准地击中影蚀领主的核心，核心破裂，暗灰色的能量如同潮水般退去。
影蚀领主死后，周围的影蚀生物失去了控制，开始四散逃窜。联合舰队趁机发起总攻，用多元共生能量净化剩余的影蚀生物。能量云逐渐消散，宇宙基因网络枢纽的淡金色光芒重新显现，变得更加耀眼。
舰队缓缓靠近枢纽，王承平站在穿梭舱的舷窗边，感受着枢纽传来的强烈共鸣 —— 他知道，启动本源共鸣的时刻，终于到来了。