很快两年的时间悄然溜走，青梧和林玉都考上了一所不错的大学，山姆也考上了大学，只有米凯拉留在了原来的城市。
青梧知道，第二部的剧情就要开始了，这两年，汽车人和人类合作无间，在世界各地消灭了大量的霸天虎成员。
但是漂亮国的政府中，始终还是有不少人反对汽车人来地球，他们觉得这些汽车人都是一帮子不稳定因素。
而还有一帮人，在不停的寻找青梧的踪迹，同样的山姆二人也被他们暗地里监视着，就想看看能不能在他们那里得到点什么线索。
此时的太空中，一艘巨大的宇宙飞船，正缓缓的往地球而来。
尽管山姆只是短暂的碰到过火种源，但是由于他是第一个接触火种源的人类，所以他还是在身体里留下了另一个坐标位置。
那是一把钥匙一样的东西，他可以开启一个装置，这个装置一旦开启，就会吸收太阳的能量，到时候就是地球的末日。
而漂亮国的政府中，最终还是反对派成功了，他们取消了汽车人和人类的合作，还试图将这些汽车人赶走。
那个愚蠢的官员，并不知道，太空中的卫星已经被霸天虎入侵，他说的每一句话，都被听的清清楚楚。
尽管不知道火种源的具体位置，但是霸天虎却得到了威震天尸体所在地。
于是天空中又落下了几个火球，他们的目的就是为了复活威震天。
青梧也想要得到那矩阵，用来启动自己的基地，现在基地虽然活了，但是他还不能离开原地。
有了那矩阵，基地就可以离开原地，变换成地上的房屋，还可以随时变换位置。
所以她并没有阻止威震天的复活，而且这次她也不准备提前出现帮忙。她准备隐在幕后，等矩阵出现了再出面抢夺。
山姆的大学生活也开始了，但是他很快就被一个美女缠上了，由于他已经有了米凯拉，所以并没有接受美女的投怀送抱。
其实他不知道的是，这根本就不是什么美女，就是一只霸天虎的先锋兵。
威震天复活之后，回到飞船中，见到了一名年纪更大的霸天虎，正是他的老师，也是初代汽车人长老之一。
威震天从他那里得到了确切的消息，那叫山姆的小子脑海里，有关于矩阵的线索。
于是山姆大学上了没几天，就又卷入了两方的战斗中，期间擎天柱被威震天杀死，他们被通缉。
好在米凯拉抓住了一只小霸天虎，在他的口中得知，汽车人其实早在很久以前，就来到了地球。
为了找到矩阵，救活擎天柱，他们在博物馆里找到了一名古老的汽车人。
这些事情，青梧都在依依的监控中全程围观,当看到那架古早战斗机，变换形态之后，老态龙钟，嘴巴下面长着胡子，手里拄着拐杖，佝偻着腰的模样。
青梧看向自己的机器人们，想着还是要改造一番，可不能多少年之后，全变成老头老太太。
这古早汽车人还是有点本事的，他竟然能够进行短暂的空间跳跃。
发动能力之后，就将众人从漂亮国，带到了沙漠中。
这里正是金字塔国的所在，据他说这矩阵就在这里的某处。
军方那边这些年一直和汽车人并肩作战，对于擎天柱的死亡都十分的伤心，当山姆联系他们，让他们将擎天柱运送到金字塔国的时候，他们二话没说就同意了。
山姆一行人也在沙漠里前进，按照他脑中的地图显示，朝着可能埋葬矩阵的地方前进。
剧情进行的很快，他们第二天就找到了汽车人长老的坟墓，矩阵就在这里。
虽然在接触到空气的时候，矩阵就化成了粉末，但是山姆想到为了救他被杀死的擎天柱，将粉末收集起来，就去和擎天柱汇合。
中途被霸天虎的队伍袭击，但是他确实是勇气可嘉，一心只想着救擎天柱，为此还差点丢了性命。
好在他得到了长老的认可，矩阵重新显现出形态，也让他救活了擎天柱。
擎天柱复活的同时，威震天出现想要抢夺矩阵，他不知道的是，青梧早就隐形在旁边等候多时了。
擎天柱复活后，她第一时间抓住矩阵，收进了空间。
矩阵凭空消失，威震天震怒，开始无差别攻击，现成擎天柱虽然复活，但是还没有恢复战斗力。
就在所有人就要陷入绝望之时，青梧显出了身形，救下了古早战斗机，拉来了一名霸天虎成员，将他拆卸，让汽车人为擎天柱治疗。
而她自己则是飞在半空中，独自对上了威震天。
“是你，又是你坏了我的好事，矩阵是不是在你手里？我劝你最好交出矩阵，不然我一定让你生不如死。”