混沌之主残魂遁逃后，万界满目疮痍。破碎的位面碎片在星空中漂浮，混沌浊流如毒蛇般缠绕着残存的世界，无数修士流离失所，昔日繁华的仙域、洪荒秘境皆沦为废墟。林尘立于九霄之上，混元剑意萦绕周身，目光扫过这片残破的天地，心中涌起强烈的责任感。
“混沌之祸虽暂歇，但残魂未灭，万界若再各自为战，迟早会被逐个吞噬。”苏瑶一袭太阴仙裙，周身月华流转，与林尘并肩而立，双生羁绊的微光在两人之间交织，“如今当务之急，是整合万界力量，建立统一的秩序，方能抵御未来的混沌反扑。”
林尘颔首，混元大道之力在体内运转，无形的威压扩散至诸天万界：“我意建立万界联邦，打破位面壁垒，共享修行资源，统一调度战力。凡愿遵联邦规则、共抗混沌者，皆为联邦之民；若有私心作祟、破坏联盟者，便是万界公敌！”
话音落下，混元剑意化作万千金光，穿透位面屏障，传遍每一个尚存的世界。东陆的修士们感念林尘昔日庇护之恩，率先响应；西域佛门高僧诵经祈福，愿以佛法护持联邦；南疆蛊师部落放下成见，承诺贡献蛊术传承；就连仙界残存的正直修士，也在太阴仙宫的感召下表示归顺。
三日后，万界中枢位面——混元界正式落成。这座由林尘以混元大道开辟的新位面，中心矗立着万丈高的联邦大殿，殿顶镶嵌着混元本源碎片与太阴本源结晶，双生之力交织成护界大阵，既能抵御混沌侵蚀，又能滋养位面生机。
联邦成立大典上，诸天万界的势力代表齐聚大殿。林尘身着混元道袍，端坐于大殿中央的主位，苏瑶立于其身侧，双生羁绊的力量化作无形气场，让在场众人心生敬畏。
“万界联邦设三大机构：议事堂、执法殿、传功阁。”林尘的声音沉稳有力，透过混元之力传遍大殿每个角落，“议事堂由各世界势力代表组成，共商万界大事；执法殿由修为高深、心性正直的修士执掌，负责维护联邦规则；传功阁开放混元大道、太阴仙法等核心传承，助力万界修士提升实力，共同抵御混沌。”
话音刚落，人群中响起一阵议论。有小世界的势力代表面露担忧：“林盟主，我等世界修士修为低微，若开放核心传承，恐难掌控，反而引发内乱。”
林尘目光柔和下来，混元大道之力化作暖流，安抚着众人的情绪：“传功阁传承将按修为境界分级，气感境至金丹境为基础篇，化神境至合道境为进阶篇，混元境传承需经议事堂审核方可修习。此外，传功阁将配备导师，指导修士修行，避免走火入魔。”
他顿了顿，继续说道：“修行之路本就步步荆棘，混沌侵蚀之下，唯有共同进步方能存活。我已将混元道果中的部分感悟融入传功阁大阵，修士在此修行，不仅能提升境界，还能淬炼道心，抵御混沌诱惑。”
苏瑶补充道：“太阴仙宫将贡献太阴本源之力，在各世界建立分殿，设立疗伤池与悟道室。凡联邦修士，皆可凭功绩兑换使用权限。功绩可通过斩杀混沌生物、修复位面屏障、捐献修行资源等方式获取。”
这番话彻底打消了众人的疑虑，各势力代表纷纷上前签署盟约，万界联邦正式宣告成立。大典结束后，林尘与苏瑶留在混元界，亲自坐镇联邦大殿，处理各项事务。
接下来的数月里，林尘忙于完善联邦规则，将混元大道的秩序之力融入联邦运转的方方面面。他发现，不同世界的修行体系差异巨大，有的侧重肉身淬炼，有的专攻神魂修炼，还有的擅长阵法符箓。为了让各体系修士能够互补互助，林尘在传功阁设立了“万法阁”，收集整理万界修行功法，取其精华去其糟粕，融合成更适合抵御混沌的修行法门。
苏瑶则致力于净化混沌侵蚀。她催动太阴本源之力，化作万千月华，滋养被混沌污染的位面。在太阴仙力的洗涤下，许多濒临破碎的小世界逐渐恢复生机，被混沌侵蚀的修士也慢慢清醒过来。期间，苏瑶发现部分修士体内的混沌之力已经与修为深度融合，强行净化会导致其修为尽废甚至身死。
“林尘，这些修士并非自愿被侵蚀，若就此放弃，未免太过残忍。”苏瑶带着一丝忧虑说道。
林尘沉吟片刻，体内药鼎秘境浮现，盘古形态的药鼎散发着开天辟地的气息：“药鼎可模拟天道推演，或许能找到剥离混沌之力又不损伤修士根基的方法。你我联手，以双生之力催动药鼎，尝试炼制‘清浊丹’。”
苏瑶点头应允，太阴本源之力与混元大道之力交织汇入药鼎。药鼎之内，混沌浊流与太阴清辉、混元金光激烈碰撞，林尘以心神掌控药鼎运转，推演丹药配方。历经七七四十九日的炼制，第一炉清浊丹终于炼成。丹药呈黑白双色，蕴含着清浊分离的道韵，散发着浓郁的药香。
他们选取了一名被混沌轻度侵蚀的金丹境修士进行试验。修士服下清浊丹后，体内混沌之力被逐渐剥离，化作黑色雾气排出体外，而修为不仅没有受损，反而因道心得到净化，隐隐有突破金丹境圆满的迹象。
“成功了！”苏瑶面露喜色，双生羁绊的力量因喜悦而愈发强烈。
林尘也是松了口气，混元大道之力运转，将清浊丹的配方与炼制之法传入传功阁：“通知各世界分殿，批量炼制清浊丹，救治被混沌侵蚀的修士。同时，传功阁需开设‘抗浊之道’课程，传授抵御混沌侵蚀的修行法门。”
随着清浊丹的普及，越来越多被混沌侵蚀的修士得到救治，万界联邦的凝聚力愈发强大。林尘在处理联邦事务的同时，也没有放松自身修行。他利用联邦收集的混元本源碎片，不断完善自身的混元大道，修为在混元境初期稳步提升，距离混元境中期仅一步之遥。
这一日，林尘正在联邦大殿的悟道室中修行，突然感应到议事堂传来急促的传讯。他收起混元剑意，身形一闪，出现在议事堂中。
只见议事堂内，各势力代表神色凝重，一名来自北境小世界的修士正跪地禀报：“林盟主，我等世界边缘出现大量混沌生物，其力量比之前遭遇的更为强大，似乎有高阶混沌存在在背后操控！”
林尘眼神一凛，混元大道之力扩散而出，瞬间感应到那处小世界的情况。果然，无数形态各异的混沌生物正疯狂冲击着位面屏障，为首的是一头体型庞大的混沌巨蟒，其气息竟达到了合道境大圆满，身上散发着与混沌之主残魂相似的波动。
“混沌之主残魂果然在暗中积蓄力量，试图卷土重来。”林尘沉声道，“执法殿即刻调动万界联军，随我前往支援。苏瑶，你坐镇混元界，稳固联邦秩序，同时密切关注其他世界的动静，防止混沌生物声东击西。”
苏瑶点头：“你务必小心，双生羁绊会时刻为你提供力量支援，若遇危险，即刻传讯于我。”
林尘周身混元剑意暴涨，化作一道金光冲出议事堂：“万界修士听令，随我出征，斩杀混沌，守护联邦！”
话音传遍混元界，无数修士响应号召，纷纷化作流光，跟随林尘朝着北境小世界飞去。一场新的混沌之战，即将爆发。