三星堆遗址的考古现场已被联盟部队封锁，雨后的泥土裹挟着青铜锈蚀的气息，临时搭建的防护棚下，青铜神树如擎天巨柱般矗立，十只神鸟雕塑在探照灯的照射下泛着青幽光泽。陆沉带着埃琳娜和考古学家李教授走到神树根部，地面上的石板刻满了盘古文明的纹路，与埃琳娜权杖的绿光产生共鸣，纹路逐渐亮起，形成一道星图投影。
“根据文明样本的记载，需要用星核水晶的能量激活纹路，才能打开密钥的藏匿处。”苏晴的声音从通讯器传来，她正在远程操控探测仪，“神树根部的土壤下有一个能量腔，密钥就藏在里面，但周围布满了机关，一旦触发就会释放暗能陷阱。”陆沉取出星核水晶，将其嵌入纹路的中心凹槽，水晶的绿光顺着纹路蔓延，地面石板缓缓向两侧分开，露出一个深约三米的能量腔。
腔底铺着金色丝绸，上面放着一块青色水晶，正是盘古密钥，水晶内封存着一道金色纹路，与地心封印的纹路完全一致。当陆沉伸手拿起密钥时，腔壁突然弹出数道暗能箭，埃琳娜及时展开圣辉屏障，将箭雨挡下。“是暗域使者留下的陷阱！他早就来过这里，只是没能打开能量腔！”埃琳娜脸色凝重，“这说明他还没有掌握盘古文明的核心技术。”
拿到第一把密钥后，三人立刻赶往古埃及。胡夫金字塔在月光的照射下泛着灰白色的光芒，塔尖的金色避雷针与密钥产生共鸣，发出微弱的金光。夜影已率影族士兵提前抵达，肃清了金字塔内的暗能守卫。“国王墓室的石棺下有一个暗格，密钥应该就在里面。”夜影的身影从暗影中浮现，手中拿着一块从守卫身上搜出的暗能结晶，“这些守卫的能量波动与烛阴相似，都是盘古文明的叛徒后裔。”
众人走进国王墓室，石棺的表面刻着法老的浮雕，浮雕边缘隐藏着盘古纹路。埃琳娜将水晶权杖轻贴浮雕，纹路亮起，石棺缓缓升起，露出下方的暗格。暗格内的密钥泛着黄色光芒，与三星堆的青色密钥相互感应，发出清脆的共鸣声。就在陆沉拿起密钥的瞬间，金字塔突然剧烈震颤，苏晴的警报声传来：“暗能同盟的舰队突袭了玛雅金字塔！陈默正在死守，但敌舰数量太多，他快撑不住了！”
陆沉立刻带着众人赶往玛雅遗址，当他们的登陆舱冲破云层时，看到的是一片惨烈的战场——陈默的登陆舱已经受损，舰身冒着黑烟，仍在顽强地阻挡暗能同盟的战舰；玛雅金字塔的顶端已经被炸毁，暗域使者正手持第三把金色密钥，准备乘坐小型战机撤离。“别想走！”陆沉驾驶登陆舱直冲战机，舱门开启的瞬间，他纵身跃出，能量刀裹挟着两把密钥的能量，如一道青黄交织的长虹直取暗域使者。
暗域使者侧身避开，将金色密钥收入怀中，背后暗能凝聚的翅膀展开，在空中与陆沉激战。两人的身影在金字塔上空交错，能量碰撞的光芒照亮了整个雨林。陆沉凭借两把密钥的能量优势，逐渐占据上风，他看准暗域使者换气的间隙，一刀劈向其翅膀根部，暗能翅膀应声断裂，使者从空中坠落，摔在金字塔的台阶上。
“盘古密钥是我的！谁也别想抢走！”暗域使者怒吼着，将金色密钥的能量全部释放，周身暗能形成一道巨型旋涡，将周围的暗能士兵吸入，躯体变得更加庞大。埃琳娜及时赶到，将水晶权杖插入金字塔的祭台，圣辉能量顺着金字塔的纹路蔓延，形成一道金色屏障，将暗域使者困住。“陆沉，用两把密钥的能量激活屏障！”埃琳娜大喊着，将自身能量注入权杖。
陆沉将两把密钥举过头顶，青黄双色光芒交织成光柱，注入金色屏障。屏障爆发出强烈的光芒，将暗域使者的暗能旋涡吞噬。使者发出一声绝望的惨叫，躯体化为暗雾消散，金色密钥掉落在地。陆沉捡起密钥，三把密钥在他手中自动贴合，形成一块三色水晶，水晶表面的盘古纹路如活物般跳动，散发出温暖的能量。
“三钥归宗了！”苏晴的声音带着喜悦传来，“我破解了加固封印的方法！需要将三色水晶嵌入地心封印的核心，同时注入三大文明的能量——光翼族的圣辉、晶族的星晶、人类的精神力！”陆沉看着手中的水晶，对众人道：“菲尼克斯率光翼族战士前往地心入口，棱光带晶族长老赶来支援，埃琳娜、陈默和我一起进入地心，激活封印！”
地心入口位于马里亚纳海沟的底部，一处由盘古文明建造的晶质拱门在海压下散发着微光，门扉萦绕的淡紫暗能表明封印已极度松动。夜影已率影族士兵布下暗影结界，阻遏暗能外泄，他的暗影披风上沾着暗能侵蚀的痕迹：“通道内暗能浓度极高，寻常护罩撑不过十分钟，但三把密钥能形成安全通道，保护我们抵达核心。”
陆沉将三色水晶举过头顶，水晶光芒如月华般铺展，在通道内开辟出一条莹白小径。众人跟在他身后，一步步深入地心。通道两侧的岩壁上，刻满了盘古文明与暗域之主战斗的壁画——先民们以血肉之躯筑成防线，用密钥的能量封印暗域之主，壁画的最后，一名盘古战士将密钥嵌入封印核心，自己化为纹路的一部分，与封印融为一体。
行至通道深处，前方骤然亮起刺目的暗紫光芒，暗域之主的意识投影如山岳般矗立，周身暗能旋涡中，隐约可见其狰狞的真容。“渺小的守护者，你们以为凭三把密钥就能阻止我吗？”暗域之主的声音如惊雷般炸响，震得众人耳膜生疼，“我已侵蚀封印核心，这里很快就会成为我的降临之地！”
菲尼克斯和棱光及时赶到，光翼族的圣辉与晶族的星晶能量交织成一道防线，挡住了暗能的冲击。“陆沉，快去核心！我们替你挡住他！”菲尼克斯的金色羽翼展开到极致，圣辉炮如暴雨般射向暗域之主。陆沉带着埃琳娜和陈默冲向封印核心，核心是一块巨大的水晶，表面布满暗能侵蚀的裂痕，正中央有一个凹槽，与三色水晶完美契合。
陆沉将水晶嵌入凹槽，埃琳娜立刻将圣辉和星晶能量注入水晶，陈默则将人类的精神力通过能量传导装置输入。三色水晶爆发出万丈光芒，金色纹路从水晶中蔓延，顺着封印核心扩散，将暗能侵蚀的裂痕逐一修复。暗域之主发出一声凄厉的哀嚎，意识投影逐渐溃散：“我不会善罢甘休的……暗能的种子已经种下，总有一天会开花结果……”
当暗域之主的意识彻底消散时，地心封印爆发出强烈的光芒，通道两侧的壁画重新焕发光彩，盘古先民的身影在光芒中浮现，对着众人微微颔首，随后化为光点消散。陆沉走出通道时，看到海面的暗能雾已经消散，地球轨道上的联盟舰队正在欢呼。苏晴的通讯传来：“陆队，地心封印的暗能指数恢复正常！全球的地质活动也稳定下来了！”
但陆沉的心情并未完全放松，他看着手中三色水晶上残留的一丝暗能，心中清楚，暗域之主虽然被击退，但暗能同盟的残余势力仍在宇宙中潜伏，这场守护宇宙的战争，还远未结束。在返回联盟总部的途中，他接到了凯伦的通讯，考古学家在南极冰层下发现了一座未知的远古遗址，遗址的纹路与暗域之主的印记极为相似，新的危机，已悄然降临。