皮卡丘、波加曼和龙虾小兵等开始收集岛上的岩石并搬到“宝石”附近，以便这只宝可梦吸收岩石能量恢复。此时，火箭队三人组追到岛上，想要再次捕捉皮卡丘和波加曼。
与此同时，晴明和小智也发现了皮卡丘和波加曼应该是随着洋流飘到了附近的一个岛屿上，最终，在一段时间的寻找下，他们最终在一个岛屿上看到了皮卡丘和波加曼。
“皮卡丘” “波加曼”
“皮卡丘” “波加，波加”
晴明看见附近附近有许多特殊的有能量的岩石，中间那里还有一颗特殊的宝石，他刚想拿起来看看，就被龙虾小兵拦住了。
皮卡丘解释了一番，虽然清明听不懂，但是见这颗宝石对龙虾小兵这么重要的样子，最终还是放弃了。
之后晴明和小智帮助龙虾小兵继续收集有能量的岩石放在那颗宝石的周围，看着宝石吸收能量的样子，晴明更加感兴趣了，不过他不会冒险。
这时，一张大网落在的皮卡丘和波加曼的头顶，把它们罩住了。这到底是什么情况。
我听到这时什么情况的声音
就以风一般的速度前来啦。
大地啊，将危险送到全世界去吧。
将危机传达至宇宙去吧。
不管是天使还是恶魔，只要呼唤你的名字
任何人听到都会颤抖的魅惑声响。
武藏，小次郎，
我是喵喵的喵喵。
时代的主角就是我们，我们是无敌的火箭队。就让我为了明天回答你吧。
哪怕是亲兄弟也要明算账的邪恶之星。火箭队登场。
晴明听到这么有个性的台词，就知道是火箭队它们，看来皮卡丘和波加曼来到这里也是他们的杰作。
小智怒道：“火箭队，快把皮卡丘和波加曼还回来。”
武藏笑道：“哟吼吼～，这是不可能的，想要啊，那就自己来拿吧。”
小次郎：“没错，想让我们火箭队把抢来的宝可梦还回去，你们是在做梦吗？”
晴明已经懒得听他们说话了，他刚想放出暴飞龙把他们赶走，身后的那颗宝石却发出了耀眼的光芒。
等到光芒渐渐消散，出现在众人眼前的是一只躯体主要为橘红色的宝可梦，面部蓝绿色，背部有三个蓝绿色的点，一道紫色条纹贯穿面部。矩形的黑色眼眶中长有白色的圆形眼睛，胸部有一块淡紫色水晶体，似乎是它的大脑，且能发射激光。
晴明拿出图鉴扫描发现并没有这个宝可梦的资料，看来这只宝可梦还没有被发现。
代欧奇希斯没有看晴明他们一眼，径直朝着火箭队的方向飞去，然后一道精神利刃把大网打破解救了皮卡丘和波加曼，之后又一记精神强念把火箭队击飞了。
代欧奇希斯把皮卡丘和波加曼放到地面上，它看着皮卡丘和波加曼，还有龙虾小兵和小球飞鱼，胸口的宝石微微发光，看起来像是在感谢什么。
不一会儿，代欧奇希斯起身，朝着天空的远方飞去，直到消失不见。
小智和小光也抱起了皮卡丘和波加曼回到了船上，继续朝着木通镇航行。
一路上，没有再次发生什么不好的事，很顺利的到达了木通镇。
到达木通镇后晴明和小智一行人先是去宝可梦中心开好房间，然后再陪小光去报名参加华丽大赛。
之后他们发现现在整个木通镇都处于祭典中，到处都在售卖“海洋宝可梦”霏欧纳的商品，听到这个名字晴明想到了那个优雅开朗的女孩，也不知道她现在怎么样了，更没想到的是她名字竟然和宝可梦同音。
后来他们听一个老婆婆说道：“据说在这个时期可以看到霏欧纳，而且如果看到霏欧纳的话幸运就会降临。”
听到老婆婆说的这话，小光眼里都闪烁着星星了，毕竟对一个女孩子来说迷信是当然的，而且对于马上就要参加华丽大赛的小光来说，这句话更是效果绝佳。
于是，抱着“绝对要看到霏欧纳的”心情，小光踏上了观赏霏欧纳的船，晴明和小智，小刚也是一样，虽然清明不相信迷信，但是如果能看到霏欧纳这种宝可梦也是很好的一件事。
晴明在船上等了一会儿，发现还是没有看见霏欧纳，于是晴明就打算放弃了。
就在这时，晴明听见一阵玩闹的声音，往那边看去，发现是三只蓝色的宝可梦，晴明一眼就看出那是霏欧纳，没想到竟然真的看见了霏欧纳，而且还是三只。
它们正在与皮卡丘，波加曼，还有卷卷耳一起玩耍。
之后它们看见了晴明一行人打算离开，可是有一只霏欧纳明显不舍，看它拉着卷卷耳的手，很容易明白这只霏欧纳应该是是喜欢上卷卷耳了。
它对皮卡丘表现出情敌意识，向皮卡丘提出挑战。皮卡丘拒绝后，卷卷耳表示如果霏欧纳能在对战中打败自己，就和它一起留在海滨生活。
对战开始，小光没有进行指挥。卷卷耳率先使用迷昏拳，被霏欧纳用影子分身躲避。接着霏欧纳在水里使用溶化，然后对卷卷耳发出超音波，使卷卷耳陷入混乱。霏欧纳趁机使用急冻光线，但处于混乱的卷卷耳竟然躲开了。卷卷耳恢复过来后，与霏欧纳的急冻光线进行对攻，最后卷卷耳趁机使用弹跳，一举打败了霏欧纳。
战败的霏欧纳独自离开，火箭队借机动手，却被霏欧纳和闻声赶来的皮卡丘、卷卷耳打飞。卷卷耳随后表示会回来看望霏欧纳，霏欧纳高兴地同众人挥手道别，和同伴一起回到海中。
小光等人结束了为第二天举行的宝可梦华丽大赛木通大会所做的特训。在点心时间，帕奇利兹看到最喜欢的宝芬非常开心，然而，宝芬却被一只“洞穴宝可梦”尖牙陆鲨踩烂了。气到发抖的帕奇利兹，因为食物的怨恨发动了新绝招“愤怒门牙”。这时，一名协调训练家乌拉拉出现制止了帕奇利兹。乌拉拉的目标是与尖牙陆鲨一起参加华丽大型庆典，所以来参加木通大会，且她不知为何对小光显示出敌意。小光忍无可忍，决定在木通大会和她一决胜负。
在木通大会上，小光和乌拉拉都顺利通过了第一轮审查。在第二轮比赛中，小光派出了帕奇利兹，乌拉拉则派出了尖牙陆鲨。帕奇利兹利用“愤怒门牙”等招式与尖牙陆鲨展开了激烈对战，最终小光凭借出色的表现获得了胜利，拿到了她的第四枚奖章。