宇宙的伤痕在新生之种的滋养下逐渐愈合，各个星域重归平静。星际守护者联盟总部建立起“宇宙平衡档案馆”，特遣队的事迹被镌刻在星图石碑上，成为激励无数文明的传奇。林羽却始终无法放松警惕，他时常在冥想中感受到一股若有若无的牵引，仿佛某个蛰伏的威胁正在黑暗中凝视。
这日，沈梦璃的超认知共鸣器突然发出尖锐警报。在银河系边缘的“星渊迷雾”星域，一颗被标记为「β-7」的废弃行星表面，检测到异常能量波动。画面中，黑色晶体如荆棘般破土而出，每一块晶体表面都流转着与青铜面具符文同源的暗紫色纹路。“这些晶体正在吸收行星的核心能量，而且...”沈梦璃放大影像，瞳孔骤缩，“它们的生长规律，和末日之种被篡改前的形态完全一致！”
机械族工程师们连夜改装飞船，在船身加装能抵御暗物质腐蚀的「熵盾」。首席工程师敲打着新安装的能量导管，金属关节发出咯吱声：“理论上能撑住三次高强度攻击，但那些晶体的能量读数...根本不像是自然形成的。”自然族树灵长老将维度之树的新芽植入飞船生态舱，翠绿藤蔓缠绕着引擎，却在感应到星渊迷雾的气息时微微发黑：“这片星域的生命脉络...被某种力量污染了。”
当飞船穿透迷雾，众人被眼前的景象震撼。「β-7」行星表面布满蛛网般的黑色晶簇，晶簇中央矗立着一座三棱形高塔，塔顶悬浮着一颗跳动的黑色晶核。塔身上雕刻的符文不断吞吐暗紫色雾气，将周围的陨石群分解成能量粒子。守秘者联盟的大咒术师翻开古籍，手却止不住颤抖：“这是‘混沌重构塔’，传说只有掌握创世神核心法则的文明，才能建造...”
话音未落，晶簇突然化作黑色巨蟒扑向飞船。这些巨蟒的鳞片由晶体构成，机械族的激光束击中后反被折射，自然族的生命之光接触瞬间被吞噬转化。林羽挥动融合武器，逆熵之力与光明之芒交织成光刃，却发现每斩断一条巨蟒，伤口处就会分裂出更多晶簇。沈梦璃通过超认知共鸣器发现关键：“晶核是所有晶体的核心！只要摧毁它...”
星际守护者联盟的新舰队从后方支援，蓝色能量网暂时困住部分晶簇。林羽带领小队驾驶穿梭机冲向高塔，却在接近时遭遇空间扭曲。无数镜像从晶簇表面浮现，每个镜像中都走出与特遣队成员一模一样的存在，他们的眼睛闪烁着暗紫色光芒，手中武器散发着毁灭气息。“是镜像复制体！它们能模仿我们的能力！”守秘者联盟的咒术师刚施展出防护咒，就被镜像咒术师以相同咒语反弹。
战斗陷入胶着时，林羽的意识突然被拉入晶核内部。这里是一片由暗紫色晶体构成的迷宫，尽头处，一个模糊的身影正在操控着晶核的运转。“你以为能阻止混沌的回归？”熟悉的声音响起，青铜面具的碎片在空中重组，“上次不过是我的试探，这次...才是真正的礼物。”他挥手间，晶核爆发出强烈的能量冲击，「β-7」行星的核心开始急速坍缩，即将形成吞噬一切的黑洞。
现实战场中，特遣队成员们伤痕累累。机械族工程师的飞船引擎开始过载，自然族树灵长老的星光身体出现裂痕，守秘者联盟的咒术师们耗尽最后一丝魔力。林羽望着即将失控的晶核，突然想起熵衡者的遗言——“混沌的本质，是宇宙的可能性” 。他将融合武器刺入地面，引导平衡领域的力量与晶核共鸣，试图将失控的混沌能量重新纳入秩序。
就在此时，星渊迷雾深处传来一声低沉的嗡鸣。比行星更巨大的黑色晶体从雾中浮现，表面刻满从未见过的古老符文。沈梦璃的超认知共鸣器发出刺耳的长鸣，屏幕上跳出血红警告：“检测到超越现有法则的能量源，混沌重构塔...只是个诱饵！” 一场关乎宇宙新秩序存亡的危机，才刚刚拉开帷幕。