特遣队重返主宇宙，却发现新生之核的光芒已如风中残烛。阿依娜的监测器疯狂闪烁：“检测到全宇宙文明能量指数暴跌！机械族的量子网络陷入瘫痪，自然族的生命树开始凋零，守秘者联盟的咒文失去效力...”宇宙各处，星系如同被抽走灵魂的躯壳，恒星黯淡，行星荒芜。
机械族中枢城的废墟下，被激活的初代文明终端投射出全息影像：“熵渊具象化正在加速...当所有文明火种熄灭，它将以实体降临。唯有重燃文明最初的信念，才能唤醒沉睡的‘维度锚点’。”画面中，一个由暗物质与绝望凝聚而成的巨型身影正在星云中成型，每一次脉动都引发时空的龟裂。
自然族的世界树主干出现蛛网状裂痕，最后的树灵长老将星光身体化作绿色光点，注入树根：“去找‘生命起源之泉’，那里封存着自然之力最纯粹的火种。”这些光点汇聚成一条闪烁的光带，指引着方向。守秘者联盟的图书馆穹顶坍塌，老咒术师继任者在废墟中找到半卷焦黑的法典，残页上用血红色咒文写着：“信念即火种，团结即维度锚点。”
特遣队循着线索抵达“荒芜星域”，这里漂浮着无数文明的残骸。队长握紧文明之剑，剑身图腾微弱地跳动：“这里曾是宇宙文明的摇篮，如今却...”话未说完，空间突然扭曲，由恐惧与绝望构成的虚维生物蜂拥而出。这些生物形似扭曲的文明符号，触碰之处，物质开始逆向分解。
林羽射出光箭，却被虚维生物吸收转化为黑暗触手；沈梦璃的意识体试图与这些生物沟通，却被灌输进无数文明覆灭的惨烈记忆。阿依娜在数据洪流中嘶喊：“它们在吞噬我们的希望！必须找到它们的核心意识！”千钧一发之际，队长将意识沉入文明之剑，在记忆深处看到：在远古时代，正是文明间首次合作点燃的希望之火，驱散过类似的黑暗。
“文明的火种，是相信彼此的勇气！”队长高举文明之剑，联合机械族最后的量子核心、自然族生命起源之泉的能量、守秘者联盟的禁咒之力，释放出璀璨光芒。光芒所到之处，虚维生物发出尖啸，开始崩解。在废墟中心，他们发现了一颗正在黯淡的水晶——维度锚点的碎片。
然而，熵渊具象化的进程并未停止。宇宙深处，那个由暗物质凝聚的身影已具雏形，它的面孔由无数文明的绝望表情拼凑而成，手中握着一把由熵增定律编织的巨镰。“所有文明的火种，都将成为我降临的祭品。”它的声音让整个宇宙为之震颤，无数星系开始加速坍缩。
特遣队将收集到的维度锚点碎片与文明之剑融合，剑身爆发出前所未有的光芒。但熵渊具象化的力量太过强大，每一次攻击都被它轻易化解。关键时刻，宇宙各处残存的文明自发汇聚力量：机械族启动最后的自毁程序，将量子能转化为希望之光；自然族的星兽燃烧生命本源，形成能量纽带；守秘者联盟的咒术师们以灵魂为引，施展禁忌咒术。
当所有力量汇聚成一道跨越维度的光束，击中熵渊具象化的核心，整个宇宙剧烈震荡。熵渊具象化的身体开始崩解，但在消失前，它将一丝暗物质注入新生之核。新生之核表面裂开一道细纹，渗出黑色雾气。“我们...还会再见。”它的声音消散在星空中，而宇宙的危机，远未真正解除。