（此为剧场版x进化的精要简洁版，看过的可以只看最后一点挖坑内容。这个蛮好看的，没看过建议补一补。）
为了更好的管理（统治）数码世界，世界树【伊古德拉希尔】制定了［方舟计划］用来清除数量众多的数码宝贝们。
用x程式来筛选出名义上被选中（幸存）的数码宝贝们，送他们进入提前创造出的新数码世界。
在这个过程中，大约有98％的数码宝贝死在了那里，在灾难的末期，数码世界重生的规则甚至彻底崩溃，死去的数码宝贝无法变成数据消散，而是成为尸体永远留在了旧世界的碎片里。
部分的数码宝贝成功活到了那个时候，还有少数幸运儿则觉醒了x抗体，变成了更强大的姿态。
但是，不在掌控之中的，迟早是要被消灭掉。以消灭拥有x抗体的数码宝贝为由，世界树命令皇家骑士对所有剩余的数码宝贝进行清扫，这令正常的数码宝贝们也视x抗体的数码宝贝们为灾祸。
在整个过程中，世界树也察觉到了部分皇家骑士起了异心（点名批评红莲骑士兽）。为此，他创造了一个天生具有x抗体的实验体（多路兽），用于研制比普通数码宝贝更加强大的扫荡兵器。
好不容易从旧世界中幸存下来，多路兽本以为可以带着狮子兽的那一份一起好好地活下去，但正常的数码宝贝却对于拥有x抗体的数码宝贝极度排斥。
为什么我会在这里？这种地方，谁都不愿意接受我……谁也不觉得需要我……这是……为什么？
在拥有x抗体被视为异端的时候，多路兽只能一只数码宝贝不停流浪，在一处没有数码宝贝生活的古建筑里安息。
直到一只战斗暴龙兽x在保护迪哥兽与［方舟计划］的执行者奥米加兽战斗时，意外落在了他的附近……
“你也有x抗体吗？真是辛苦你了……”
这是那么久以来第一次，有数码宝贝对多路兽说——辛苦你了……
“作为你的同伴，我有一个请求……”
“同伴？”
也是这么久以来第一次有数码宝贝愿意将多路兽当成同伴……
“没错，你应该明白吧，我也同样有x抗体，我现在必须回去救其他人，这段时间可以拜托你帮忙照顾这孩子吗？请保护好这孩子。”
照顾迪哥兽？保护迪哥兽？我能做到吗？
“没问题的，相信你一定做得到。”
多路兽答应了战斗暴龙兽x，要保护好迪哥兽。在那之后，即使对手是奥米加兽，他也顽强地反抗着。
在一次又一次的撞击中，那种想要保护的心情，那种想要活下去的想法，动摇着奥米加兽的信念。
为什么？明明知道他们不堪一击，我为什么要任由这些孩子打……
赶来救援的钢铁加鲁鲁兽x挡住了奥米加兽的攻击，把自己x抗体给了感染了x程式的迪哥兽，救下了迪哥兽和多路兽，死在了多路兽面前。
活下去……带着我的那一份一起……
在极度的不甘下，多路兽进化成了多路加兽，带着又一次被他人“赠予”的生命，和一同前来救援的战斗暴龙兽x对战奥米加兽。
“为什么？为什么还要战斗？”
“为了活下去……我说过了，我要活下去……为了让生命延续，我要去战斗！”
“世界树……不希望如此……”
奥米加兽犹豫着，但还是遵循着世界树的命令，想要对两人出手。在红莲骑士兽的阻止下，战斗暴龙兽x得以说出有关［方舟计划］第一阶段的真相。
［方舟计划］早已进入第二阶段——消灭所有的数码宝贝。这样的决定，超出了红莲骑士兽所能接受的范围。
多路加兽活了下来，但世界树的实验已经成功。之后，在世界树的命令下，金甲龙兽抓住多路加兽交给了世界树。
通过扫描多路加兽的数据，世界树制造出了只知道消灭数码宝贝的生物兵器——死x多路暴龙兽，对剩余的数码宝贝们进行清扫。
木乃伊兽、巫师兽……还有许许多多为了生存而战斗的数码宝贝，但这在数不清的死x多路暴龙兽面前，也只是杯水车薪。
“住手————！！”
在被肆意残害的生命面前，多路加兽愤怒地进化成了多路暴龙兽。那相似与死x多路暴龙兽的外貌，让现场的数码宝贝感到不解，敌视着他，也让多路暴龙兽自己迷茫。
“怎么会……我这是……？”
短暂地消沉过后，多路暴龙兽选择了和死x战斗，救下其他的数码宝贝，即使受伤也在所不惜。
这拼命地行为让迪哥兽依旧安心落在了他的身边蹦蹦跳跳，其他数码宝贝们也选择一致，和他一起对抗现在的危机。
获得了x抗体后的红莲骑士兽及时救场，让战斗暴龙兽x和钢铁加鲁鲁兽x带领其他的数码宝贝离开这里，独自让多路暴龙兽留了下来。
“我活下来，真的好吗？如果我死了，就不会像现在这样了……”
数不清的数码宝贝被肆意屠杀，剩余的数码宝贝们只能在死亡中寻求生存……
“我也想知道这个答案，我究竟是什么东西？为什么我会在这里？任何生命都希望生存，没有哪个生命，从他出生起就被这个世界拒绝。
多路暴龙兽！去世界树那里吧！你也想知道自己究竟是什么东西吧？！”
红莲骑士兽为多路暴龙兽打开了前往面见世界树的大门，自己留下来独自阻拦死x多路暴龙兽群。
在多路暴龙兽见到世界树的面前，奥米加兽成为了最后一道阻碍。已经无法忍受数码世界现在的混乱，奥米加兽本打算去面见世界树，但多路暴龙兽的到来，让他隐隐有些明白了红莲骑士兽的用意。
“我们之间只有一个能得到答案，打败我，我就能满足你去见世界树的愿望。”
“为…为什么要这样做？”
“我们的想法很相似，那么我们之间只要有一个人能到达世界树那里，领悟到真实的答案就好。”
“等等，没时间了，再不快点见到世界树的话，数码世界会……”
“如果你见到了世界树，找到了答案的话，数码世界就不会灭亡了吗？！连和我交手的力量都没有，见到世界树又有什么用？”
“不是，我不希望战斗……我没有理由和你战斗！”
“即使你没有，可我有。你是赌上了什么来到这里？！”
“堵上存在的一切……”
“那么，来战斗吧。向我证明你所赌上的一切！”
奥米加兽不断刺激着多路暴龙兽，激发着他的斗志，在金甲龙兽震惊的眼神中，传说中的圣骑士——阿尔法兽诞生了。
世界树利用多路兽培育出的死x多路战龙兽挡在了两位皇家骑士的面前，即使成功消灭，但他又进化成了更强大的死x兽。
阿尔法兽发现死x兽是其影子，主动和他同归于尽，把自身的x抗体交给了奥米加兽，让进化成了更强大的姿态。
“全部删除！”
世界树被消灭（？）掉了，数码世界渴望生存的数码宝贝活了下来。但好景不长，黑暗领域的势力趁着这段空虚期，大举进攻，皇家骑士们为了保护数码世界，或是战死，或是下落不明，付出惨痛的代价击退了他们。
剩余的皇家骑士拖着残破不堪的身躯，继续游荡在数码世界，见证着下一任管理者的兴盛与衰替。
在往后的日子里，数码世界出现了数任管理者，但无一例外，都无法长久，或是暴虐，或是堕落。
一直到现在在时间中诞生的进化意识——恒常性……