光之王国的历史悠久，早先的他们，心地善良，王国里充满了温暖的光。那时候，“圣母”这个词，人们并不觉得是个贬义词，反而觉得，这个词代指了拯救世界的人。
可是后来，光之王国的长老变得昏庸无道，他知道人们害怕黑暗植物，于是便企图利用红晶石和黑暗植物来控制王国。光之生物一旦失去光能，就会变异成黑暗生物。光之王国的子民，为了恢复光芒万丈的以往，他们无休无止地清理黑暗植物。但是黑暗植物却越来越多，他们疲于奔命，生活越发艰难。光之王国，每时每刻都降落红石，每时每刻都生长黑暗植物。为了国王一个人的野心，他们全天下都要陪葬。
但是，光之王国有一个小女孩，名叫程雨。她下定决心，想要成为圣母。眼见光之王国被黑暗入侵，民不聊生，不甘心人们生活在水深火热之中。她做了一个决定：要燃烧自己一生的光和热，去治愈黑暗。
别人可不这么认为，在他们的眼里，黑暗是不可能被治愈的。他们只觉得小女孩痴心妄想，自不量力。“小雨，妈妈劝你不要去做这种傻事，现在黑暗已经是不可能被治愈的了，我们要学会的，是与黑暗共存，而不是去治愈黑暗。”“天哪，就凭你这个小身板，还想去治愈黑暗？简直就是以卵击石，自不量力啊！”“看她怎么治愈，我看她就算治愈了几百年都不能做到……”
但是，有一个小男孩，坚定地站在她旁边。他叫祁渊，从小就不相信什么圣母救世的传说。但是在程雨的眼中，祁渊看到了闪闪的星光。祁渊的家族，守护的是光之生物中的白鱼。程雨的家族，守护的则是遥鲲。前者威武勇敢，是光之王国的将领。后者代表着救赎与治愈，是光之王国的祭司。族人与神兽的感知，通常紧密联系。
有一天，祁渊想要去找程雨一起玩，可是没找到。他去问晨岛长老：“长老，请问您知道程雨去哪儿玩了吗？”“她？她啊……她估计又去拯救黑暗植物了吧。”晨岛长老叹了一口气，“唉，她真是太天真了，太傻了，明明黑暗就不可能被治愈。比如飞蛾，不顾一切地扑火，以为自己能够得到光明，事实上只是被火烧死。她就要像飞蛾一样，企图治愈黑暗，最后只能是被黑暗控制。”祁渊听着，摇了摇头，什么也没说，匆匆地离去了。
祁渊在雨林的密林遗迹找到了程雨。最近雨林的黑暗植物变得更加浓厚，更加容易侵略光之生物。一旦被黑暗植物附身，持续地失去体力，还是很痛苦的。程雨的能量正在一点一点地被吞噬，无法脱身。
祁渊看着这一幕，很是难受，他顾不得多想，抽出自己的佩剑斩断了黑暗植物的藤蔓，生气地质问程雨：“为什么任由它困住你？为什么不烧掉它？你真是个笨蛋啊！”程雨刚从黑暗植物的藤蔓脱身，还很虚弱：“我……我想感化它，因为黑暗植物也是无辜的，它本来也是光之植物，可是它不小心吸收了黑暗失去了光。我就想试试，能不能用我的光能去治愈它温暖它，而不是杀死它。”
“可是黑暗生物就是黑暗生物啊，他是我们的对立面，我们不能对自己的敌人手下留情，否则就是对自己残忍！”祁渊的目光中燃烧着熊熊烈焰，“如果我来晚一步，你就……”他硬生生地把这个词吞了，“如果那样，我要把光之王国的黑暗都烧光！不能让像你这样的人受到一点伤害！”程雨没敢再说什么话。
但是程雨没有注意到，祁渊眼中除了怒火，还有戾气。祁渊是个嫉恶如仇的孩子，这是一种很强烈的情感，在光之王国黑暗的时代，会发生不可逆转的改变。程雨后悔了一辈子：如果当时我有能力阻止他就好了……那样，我们就不会走向对立面。
光之王国的国王，越发堕落，榨干了别的生物的能量后，为了再榨取能量，他把目光投向了遥鲲家族和白鱼家族。两家人都很紧张，每天都在和黑暗势力斗智斗勇。祁渊已成少年，程雨也是成熟的少女了。祁渊的家人，一个个失去了光能，化为了冥龙。
祁渊眼见光之王国的黑暗，嫉恶如仇的他早已对光之王国心灰意冷。但是当他得知，程雨的家族也深受其害后，他忍无可忍。大量的遥鲲被放在机器上，榨取光能。这是丧尽天良的事，可惜程雨天性善良，任人宰割还无怨无悔，一边被凌迟着，一边对人微笑，希望能感化光之王国，治愈黑暗。
曾经充满着温暖的光的王国，如今从里腐烂到外。光之王国，困住了遥鲲，它自己已然沦为黑暗充斥的王国。祁渊看着身边的人一个个被黑暗吞噬，心如刀绞。他做了一个决定：既然如此，我就要把光之王国砸烂，烧成灰，救回程雨，无论我付出了怎样的代价！他闭上眼，看见了光之王国的国王。他向国王臣服，从那里获得可怕的力量。
终于有一天，祁渊与程雨在暮土荒原相见。墨绿色的天空下，黑水茫茫，从天上透下来的几丝微弱的光，苍白无力地撒在了水上。一只冥龙，疯狂地撞向最后的那只遥鲲。它们不能说话，但仿佛有祁渊的声音：“程雨，不要害怕了，我一定会把你从黑暗中救出的……”也仿佛有程雨的回答：“祁渊，谢谢你，但我不要了，我要让黑暗王国重新变回光之王国……”
冥龙撞向遥鲲，仿佛有祁渊说话：“不，不要，程雨，答应我，我要救你出去……”随着一声撞击声，遥鲲消失了。程雨似乎飞向了遥远的光之王国……