泥偶巨人飞的很快，没一会就来到了布拉塔诺博士的研究所。“不好意思？布拉塔诺博士你在这里吗？”小智一进去研究所就大喊起来。“来了，”布拉塔诺博士走出来看到了小智手里的呱呱泡蛙：“呱呱泡蛙，这是怎么回事。”
小智：“你认识这只呱呱泡蛙吗？”布拉塔诺博士回答：“我当然认识，苏菲快点过来，我真的好担心哎，你的训练家之前有跟我联络过。”布拉塔诺博士接过呱呱泡蛙对他说。然后就将呱呱泡蛙交给赶来的苏菲，苏菲带着呱呱泡蛙前往医疗室。
“那个，不好意思，你刚刚说的联络？是指呱呱泡蛙的训练家打算过来这里吗？”小智问道。布拉塔诺博士一脸严肃的说：“不是的，他联络我，是打算放弃呱呱泡蛙。”这时候瑟拉尔走上前去：“博士，好久不见。”布拉塔诺博士也对瑟拉尔说：“瑟拉尔啊，真是好久不见呢。”
几人站在医疗室旁边，小智看着里面的呱呱泡蛙，心里止不住的担心。布拉塔诺博士看出了小智的担心：“你们不必担心，他的本领可是很强的哦。”布拉塔诺博士找了个地方坐下：“自我介绍一下，我叫布拉塔诺，是卡洛斯地区的宝可梦研究家。”
小智回答：“我的名字叫做小智，他是我的伙伴皮卡丘，我今天才从关都地区的真新镇抵达这里。”“关都地区？”“是，我的目标是成为宝可梦大师。”布拉塔诺博士点点头：“原来如此啊，这么说来，我还没有向你道谢呢，真的很谢谢你救了呱呱泡蛙。”
小智：“是我们应该跟你道谢才对。还有，我想请问，刚刚你说对方放弃了呱呱泡蛙到底是怎么回事？”
布拉塔诺博士听到小智这么说，也是解释道：“你应该知道我的工作就是将最初的宝可梦交给新人训练家，而呱呱泡蛙正是新人训练家使用的宝可梦。不过那个孩子的性格比较奇怪，不但不肯听从训练家的指挥，还会放弃训练家，从训练家身边逃走，本来应该踏上旅程的，但是有好几个训练家回到这里将呱呱泡蛙还给我。”
小智几人都露出震惊：“竟然还发生过好几次！”布拉塔诺博士叹了一口气：“可能呱呱泡蛙有自己的考量吧。”这时候一旁出现了一只烈咬陆鲨，他看着正在治疗的呱呱泡蛙，给他加油打气。“是烈咬陆鲨哎。”小智说。布拉塔诺博士走过去拍了拍烈咬陆鲨：“这是我们家的烈咬陆鲨，他的脾气很好。”
烈咬陆鲨回头，布拉塔诺博士：“烈咬陆鲨，你状况还好吗？”烈咬陆鲨点点头，继续看着里面的呱呱泡蛙。博士安慰道：“呱呱泡蛙他没事，多亏小智他们救了他。”烈咬陆鲨回头感谢了小智。柚莉嘉问博士：“博士，我可以摸摸他吗？我第一次见到真正的烈咬陆鲨哎。”
博士欣然同意：“请吧，他一定会很开心的。”柚莉嘉被博士抱着摸了摸烈咬陆鲨：“烈咬陆鲨，你好乖哦，好可爱。”希特隆走过来：“博士，您现在进行的研究是宝可梦的进化吧。”博士点头：“没错，所以研究所里也有许许多多的宝可梦啊。”柚莉嘉表示她想看，博士也带着他们一起前往宝可梦们所在的地方。
希特隆问：“小智不过来看吗？”小智表示他想就在这里照看呱呱泡蛙。小智走到呱呱泡蛙身边：“呱呱泡蛙，真的很谢谢你刚才帮了我大忙…”瑟拉尔见状，也离开这里，让小智与呱呱泡蛙独处，毕竟呱呱泡蛙以后可是小智的超级王牌啊。
视角来到另一边。柚莉嘉开心的与研究所里的宝可梦玩耍。小智也来到了这里，希特隆询问呱呱泡蛙的状况，小智：“不用担心，他很强悍的。”“小智你快看，这里有好多从来未见过的宝可梦啊。”柚莉嘉抱着蛇纹熊对小智说。
皮卡丘也跳下来与宝可梦问玩做一团。小智这时候问：“博士，你说的进化研究，是指什么样的研究啊？”博士回答：“如果有人说，宝可梦还有另外一个阶段的进化，你会相信吗？”“另一个进化！”此时瑟拉尔也来到了这里，博士见状邀请瑟拉尔给几人展示。
瑟拉尔答应后，将身上的一个精灵球交换：“去吧，艾路雷朵。回应你我战斗之激情，超进化吧，艾路雷朵！”艾路雷朵身上出现了超进化的标志后发出了耀眼的光芒，不一会光芒散去，超级艾路雷朵出现在众人面前。小智看着改变形态的艾路雷朵：“好厉害啊！”
一旁的希特隆问：“博士，请问烈咬陆鲨也可以进行这种进化吗？”“非常有可能哦，有好几只宝可梦都显示出了这种名为超进化的情况。”“超进化？”博士继续说道：“但是关于超进化的原因，还有很多未解的谜团。比如进化所需要的特殊石头，还有训练家与宝可梦之间的羁绊也被认为是很重要的因素。”
“而且令人惊讶的是，就算宝可梦进化，也会恢复原状哦。”艾路雷朵也退出了超级模式。“真的变回来了哎！”就在几人聊天的功夫，殊不知房顶上竟然有人窃听…
“哈喽，你好啊，我们是来进行超进化研究的。”三个人推开大门。呱呱泡蛙突然跑过来：“呱呱！”烈咬陆鲨听到呱呱泡蛙的话，也警惕起来，一名工作人员刚才去询问博士了。“我们就从他抓起吧。”小次郎朝着呱呱泡蛙扔出一个机器，武藏也推开另一个工作人员。
烈咬陆鲨挡在呱呱泡蛙身前，机器命中他。突然，机器变成一个项圈，控制住了烈咬陆鲨！呱呱泡蛙想将机器项圈拆掉，却被弹飞了出去。博士几人听到了烈咬陆鲨的叫声，急忙朝这边赶过来。烈咬陆鲨挣扎起来，胡乱破坏，然后不小心撞坏了项圈。
“烈咬陆鲨，你没事吧？”博士此时也来到了这里。“耿鬼，冲过去将那个东西拆了。”瑟拉尔派出耿鬼，却被烈咬陆鲨打了回来（这里主角开始划水了）。博士看着那几个人：“你们究竟是什么人？”“既然你诚心诚意的问了…”（直接跳过）
“火箭队，又是你们！快将烈咬陆鲨还回来！”“我们才不要嘞，那么这只烈咬陆鲨我们就收下了。”博士惊讶：“喵喵说话了？”“对啊，我会说话啊喵。”但是烈咬陆鲨却直接一招将火箭队几人打飞出去。“不会吧！好讨厌的感觉啊！”
但是烈咬陆鲨依然处于失控状态，抬手一招朝着博士几人打过来。“脱壳忍者，顶住。”瑟拉尔派出了脱壳忍者，龙之怒打在他身上一点作用也没有。希特隆：“博士，你快看烈咬陆鲨的脖子。”博士也看到了那个项圈。
烈咬陆鲨突然飞出研究所。博士问：“那个项圈究竟怎么回事？”研究人员讲述了事情的经过后，众人也明白了事情的经过。“怎么会变成这样？”柚莉嘉抱住希特隆，眼角含着泪花。呱呱泡蛙也跟上小智：“呱呱泡蛙你也想一起来吗？”“呱呱”