申时行的想法是将对于山西、河南等内陆省份进行财政补贴，将朝廷的赋税予以分配，实施均输之法，保障这些地方百姓能够有足够的收益，同时利用赋税来加强朝廷对于这些地方的补贴，对于道路和交通设施予以加强，这样的话，就可以使得这些百姓们获得足够的收益，使得他们的生计得以保障，同时也使得这些百姓的能够参与到朝廷开海所形成的产业链当中，这样就可以使得这些地方也从朝廷的开海中获益。
然后在改善了交通等基础设施之后，河南等地的工商业就能够较好的发展了，这是申时行的想法，但是沈鲤等人坚决反对这个做法，沈鲤认为，这样一来，河南等地就成为了南直等地的原料产地和商品市场，对于河南来说，始终是处于一个不利的地位，一旦朝廷的财政吃紧，必然优先减少对于河南地方财政的各种支持，以保证朝廷的用度，大家都是官场上的老狐狸了，整这些聊斋骗不了任何人，这点这些老狐狸都是很清楚的。
沈鲤很清楚，要想摆脱这种情况，必须要在河南发展工商业，而不是让河南等内陆省份成为沿海的原料产地和商品市场，所以沈鲤、王家屏等人对于申时行的这个方案予以反对，他们认为河南等内陆省份应该凭借自己的资源禀赋等发展自己的工商业，和沿海地区的工商业形成互补，这个过程必须要有朝廷的强力干预，这点是极为重要的。
沈鲤他们是很清楚的，这些内陆省份在刚刚开始发展的时候，其工业产品的质量和竞争力确实是不如东南等地的，这就需要朝廷的支持的，朝廷必须动用政策手段或者是赋税等财政手段，对于这些内陆省份的工商业是要进行保护的，这也需要朝廷通过行政命令强制将沿海各省的相关技术、工场等迁移到内陆去，这点是极为重要的。
对于沈鲤的这个看法，申时行是有些反对，申时行一向反对予以工商业做过多的干预，申时行认为经济有自身的规律，行商坐贾，自有其道，朝廷不必对于此事有过多的干涉，这样才能够使得经济能够发展起来，朝廷强行干涉经济，未必会取得很好的效果，这点是申时行的一向观点，在这种情况下，申时行对于沈鲤的观点是不置可否的。
而王家屏则是提出了自己的看法，就是山西的煤铁产业问题，山西拥有天然的发展煤铁的资源禀赋，在这种情况之下，山西是由于朝廷的政策导致了现在无法发展起来的，而现在朝廷对于煤炭的需求显然是极为巨大的，需要大量的煤炭用于各种机械，北直的煤矿远远不能够满足朝廷的需求，大规模开发山西的煤铁，这样可以振兴山西的经济。
但是朝廷以防备北虏为由，严格限制山西的煤铁发展，这对于山西来说是无法接受的，所以王家屏要求申时行将放开山西的煤铁发展作为这次讨论的一个议题，从内阁会商开始，各位阁臣的立场就是很对立的，申时行自然是很清楚沿海省份在朝廷开海中确实是获利甚大，在这种情况必须要给内陆省份让出利益才行，这点申时行是早就想到了的，申时行的看法维持现有的这个经济体制，同时利用朝廷以财政的手段对于这些内陆省份加以补贴，这样的话，就可以比较好的解决这个问题。
但是沈鲤、陈于陛、王家屏等人显然不是这么看的，他们希望的是朝廷的政策从支持沿海省份到支持内陆省份上来，进行政策的转变，加强大明全国的工商业基础建设，这和申时行的继续支持沿海的政策显然是冲突的，但是申时行也很清楚，作为首辅，自己必须要在这个事情处于中立的角色。
所以有些话还是要罗万化、王锡爵来说，他们两人认为，朝廷并非是不支持内陆省份发展工商业，但是凡事要讲究个循序渐进，不能一蹴而就嘛，现在内陆省份既没有资金，也没有技术，基础设施尤其是交通等事项也是非常之差的，在现在这种情况下，立即就发展各种工商业条件尚不成熟。
而除此之外，山西毕竟紧邻北虏，要想发展煤铁产业，并非不可，但是必须要在朝廷的严格控制之下才行，尽管现在北虏对大明很恭顺，但是蛮夷犬羊之性，未可轻忽，所以对于铁料流入北虏，还是要持非常谨慎的态度，对于铁料予以严格禁榷，这点是极为重要的。
申时行并没有就此事再发表意见，而且决定将这些意见予以记录，上陈圣裁，阁臣们也纷纷以密疏的形式给朱载坖上疏，陈述自己的观点，申时行也上疏向朱载坖陈述了自己的观点，申时行认为现在并非不能发展内陆省份的工商业，但是内陆省份和沿海的工商也是不同的，沿海的工商业主要是外贸导向，是要用于出口的，而内陆的工商业主要是为了满足本地或者是大明国内的市场需求，同时也是为沿海的工商业提供各种原料的作用，两种工商业还是有很大的不同的，要有区别的发展才行。
同时就是在内陆发展工商业的成本和收益问题，朝廷肯定是需要投入更多的资金，见效肯定也没有沿海这么快，这些事情都是申时行预见到了的，所以申时行认为，朝廷既要平衡内陆和沿海之间的差距，也要继续坚持沿海的工商业发展，因为对于大明来说，现在沿海数省对于大明财政的地位是极为重要的，此事关乎朝廷的财政安全，是绝对不容轻忽的。
户部尚书庞尚鹏也向朱载坖上疏，强调要因地制宜，不能蛮干，这点是最重要的事情，朝廷在这件事情上不仅仅是要听取地方官府的意见，还有就是商人、工场主的意见也是很重要的。