天启六年七月初三，熊文灿经过长途跋涉在险象环生中终于到了北京，回到府邸已经到了申时，刚坐下来喝口茶给李义安排住的地方时，熊文灿的夫人走了出来行了个万福礼熊文灿介绍了下李义，李义作揖道：“见过夫人”熊夫人也很知书达理，回了个万福，熊文灿让熊三带他去住的地方看看有什么不足的地方让熊三安排，熊三应了一声带李义去看了一下厢房，只见房间里一张床一张圆桌四张凳子一块屏风一个衣柜，李义想了下，想要一张书桌和书架，书最好是大明朝人编写的名家大作，四书五经也搞点还有什么史料和地理天文这些书就行，熊三拍了他一下，没问题交给我了，忙活到戌时才弄好，正准备去前厅找熊文灿商量开肥皂作坊的事，这个时候门外进来一个小太监，熊文灿一见到他上去就客套起来：“原来是王公公来了，有失远迎还请恕罪。”王公公见熊文灿好好的便用尖细的嗓音说道：“熊大人不用这么客气，咱家是替皇帝来看您的。一开始陛下听说您在扬州被烧死了气了都准备把扬州府上上下下的官员砍得干干净净，还是魏公公见多识广觉得里面有猫腻劝陛下冷静下来多等些时日。果然，您一离开通州东厂番子就发现您了，立马进宫秉报陛下，陛下大喜特地让咱家过来通知您明天早上要开朝会让您把这次的事写个折子报上去，陛下想知道谁这么大胆。”熊文灿听完，哆嗦了一下说道：“公公烦请您禀报陛下，此事牵扯甚大，处理不好就会引得朝堂震荡。”王公公听了，眉头一皱虽然他是内官但也是在魏忠贤身边待了好些年也算有些见识。起身表示此事会向陛下禀报，熊文灿送走了王公公坐下叹了口气，回到书房写折子李义见他在忙就没有过去，而是回到房间拿出许久没用的手机找到明朝典籍里可能用的到的东西又是写又是画的，折腾了一夜。
第二天早上熊文灿寅时就来到了午门外集结等待上朝，陆续过来的官员都在向他道贺升任兵部尚书，只有几个御史和翰林院的假装没看见，熊文灿也不在意这帮御史和翰林院的总是自视清高觉得自己高人一等，整天喷这个骂那个，动不动就弹劾别人还犟得像头驴。熊文灿正想着待会儿怎么跟皇帝说那些事儿，只见一个太监走过来让众人进入朝房点卯都规规矩矩的按品级站好，毕竟是有御史在记录一不小心就得挨批。点卯结束众大臣在钟鼓司的奏乐声中进入太和门，文武官员分列左右站立天启皇帝朱由校缓步走到龙椅上坐好，鸿胪寺开始唱班官员行跪拜大礼，魏忠贤在旁边站立掐着尖锐的嗓音喊道有事启奏无事退朝。
朝堂十分安静，朱由校看了一圈目光盯在了熊文灿身上，说道：“兵部尚书熊文灿何在？”熊文灿看了左右一眼，手拿奏折出班道：“陛下，臣在。”朱由校又说道：“熊卿家，听闻你返京途中两次有歹人企图行刺于你，此事可属实？”熊文灿答道：“正是如此，此事我已经写好了奏折，臣在扬州时扬州知府曾给微臣接风洗尘，当时臣不胜酒力便让人扶臣回驿站歇息，路上凉风一吹微臣酒醒了差不多，在驿站歇了一会儿就回船上赶路了，后来得知臣走后没多久驿站就失火了，第二次是在山东被一群水贼伏击，后来捉了几个人有一个人要说出幕后黑手时被另外两人掐死，其他几人抢了刀自杀了。”群臣听完大惊失色，朝堂立马就嘈杂了起来，魏忠贤见状扯着尖锐的嗓子喊道：“肃静。”众臣才逐渐安静下来，魏忠贤对天启拱了拱手。
首辅叶向高在众人安静后，出班道：“陛下，堂堂朝廷正二品尚书竟在一千五百里的路上被人刺杀两次，如此骇人听闻的事在我朝极其罕见，据我所知熊大人自万历三十五年中举到现在已经快二十年，在地方任职期间深受百姓爱戴，有歹人竟两次企图刺杀朝廷栋梁请陛下严查还熊大人一个公道。”刚说完，户部尚书郭允厚、刑部尚书苏茂相、工部尚书黄克缵；、工部右侍郎何乔远、文渊大学士史继偕、 礼部侍郎张瑞图、詹事府少詹事兼 翰林院侍读学士杨景辰、 翰林院修撰庄际昌、翰林院修编蒋德景等人先后出班为熊文灿说话，毕竟他们也知道，如果今天不站出来，保不准将来哪天自己也出了这样的事就没人给自己说话了。
朱由校听完点了点头道：“爱卿们所言极是，朕也是这样想的，下旨。”魏忠贤在一旁仔细听着，朱由校又说道：“令锦衣卫、东厂和大理寺联手查案，必须一查到底，魏忠贤、田尔耕必须要亲自督办，扬州知府刘奇渎职险些造成朝廷重臣殒命，罢官下锦衣卫诏狱一查到底，山东布政司从上到下一查到底，凡有阻碍可先斩后奏。”魏忠贤记完，把笔墨给了旁边的小太监，朱由校又说道，熊爱卿任兵部尚书担子还是很重的，从今天开始给你一年的时间把京城三大营和腾骧四卫给朕整顿好，还有五城兵马司要用谁你说的算，要谁帮忙你可以去找，所有与兵事相关的人你都可以找，谁不配合你就找朕或者找英国公和魏大伴。必要的时候东厂和锦衣卫都可以配合你，朝堂上的人全都安静了只有英国公张维贤应了一声，熊文灿脑子一晕这皇帝上来就给这么多活还都是和勋贵利益相关的事，想想就头疼。